Protein–RNA interactions for Protein: P54278

PMS2, Mismatch repair endonuclease PMS2, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P54278 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PMS2P54278 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PMS2P54278 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PMS2P54278 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PMS2P54278 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PMS2P54278 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PMS2P54278 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PMS2P54278 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PMS2P54278 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PMS2P54278 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PMS2P54278 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PMS2P54278 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PMS2P54278 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PMS2P54278 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PMS2P54278 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PMS2P54278 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PMS2P54278 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PMS2P54278 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PMS2P54278 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PMS2P54278 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PMS2P54278 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PMS2P54278 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PMS2P54278 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PMS2P54278 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PMS2P54278 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PMS2P54278 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PMS2P54278 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PMS2P54278 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PMS2P54278 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PMS2P54278 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PMS2P54278 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PMS2P54278 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PMS2P54278 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PMS2P54278 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PMS2P54278 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PMS2P54278 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PMS2P54278 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PMS2P54278 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PMS2P54278 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PMS2P54278 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
PMS2P54278 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
PMS2P54278 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
PMS2P54278 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PMS2P54278 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PMS2P54278 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PMS2P54278 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PMS2P54278 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PMS2P54278 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PMS2P54278 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PMS2P54278 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PMS2P54278 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PMS2P54278 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PMS2P54278 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PMS2P54278 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PMS2P54278 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PMS2P54278 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PMS2P54278 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PMS2P54278 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PMS2P54278 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PMS2P54278 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PMS2P54278 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PMS2P54278 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PMS2P54278 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PMS2P54278 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PMS2P54278 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PMS2P54278 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PMS2P54278 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PMS2P54278 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PMS2P54278 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PMS2P54278 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PMS2P54278 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PMS2P54278 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PMS2P54278 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PMS2P54278 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PMS2P54278 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PMS2P54278 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PMS2P54278 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PMS2P54278 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PMS2P54278 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PMS2P54278 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PMS2P54278 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PMS2P54278 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PMS2P54278 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PMS2P54278 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PMS2P54278 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PMS2P54278 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PMS2P54278 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PMS2P54278 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PMS2P54278 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PMS2P54278 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PMS2P54278 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PMS2P54278 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PMS2P54278 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PMS2P54278 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PMS2P54278 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PMS2P54278 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PMS2P54278 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PMS2P54278 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PMS2P54278 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PMS2P54278 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms