Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
COPAP53621 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
COPAP53621 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
COPAP53621 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
COPAP53621 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
COPAP53621 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
COPAP53621 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
COPAP53621 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
COPAP53621 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
COPAP53621 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
COPAP53621 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
COPAP53621 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
COPAP53621 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
COPAP53621 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
COPAP53621 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
COPAP53621 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
COPAP53621 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
COPAP53621 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
COPAP53621 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
COPAP53621 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
COPAP53621 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
COPAP53621 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
COPAP53621 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
COPAP53621 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
COPAP53621 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
COPAP53621 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
COPAP53621 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
COPAP53621 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
COPAP53621 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
COPAP53621 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
COPAP53621 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
COPAP53621 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
COPAP53621 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
COPAP53621 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
COPAP53621 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
COPAP53621 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
COPAP53621 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
COPAP53621 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
COPAP53621 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
COPAP53621 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
COPAP53621 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
COPAP53621 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
COPAP53621 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
COPAP53621 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
COPAP53621 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
COPAP53621 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
COPAP53621 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
COPAP53621 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
COPAP53621 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
COPAP53621 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
COPAP53621 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
COPAP53621 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
COPAP53621 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
COPAP53621 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
COPAP53621 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
COPAP53621 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
COPAP53621 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
COPAP53621 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
COPAP53621 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
COPAP53621 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
COPAP53621 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
COPAP53621 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
COPAP53621 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
COPAP53621 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
COPAP53621 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
COPAP53621 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
COPAP53621 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
COPAP53621 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
COPAP53621 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
COPAP53621 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
COPAP53621 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
COPAP53621 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
COPAP53621 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
COPAP53621 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
COPAP53621 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
COPAP53621 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
COPAP53621 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
COPAP53621 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
COPAP53621 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
COPAP53621 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
COPAP53621 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
COPAP53621 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
COPAP53621 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
COPAP53621 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
COPAP53621 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
COPAP53621 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
COPAP53621 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
COPAP53621 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
COPAP53621 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
COPAP53621 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
COPAP53621 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
COPAP53621 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
COPAP53621 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
COPAP53621 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
COPAP53621 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
COPAP53621 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
COPAP53621 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
COPAP53621 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
COPAP53621 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
COPAP53621 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms