Protein–RNA interactions for Protein: P53611

RABGGTB, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTBP53611 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
RABGGTBP53611 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RABGGTBP53611 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RABGGTBP53611 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RABGGTBP53611 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RABGGTBP53611 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RABGGTBP53611 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RABGGTBP53611 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RABGGTBP53611 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RABGGTBP53611 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
RABGGTBP53611 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
RABGGTBP53611 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
RABGGTBP53611 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
RABGGTBP53611 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
RABGGTBP53611 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
RABGGTBP53611 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
RABGGTBP53611 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
RABGGTBP53611 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
RABGGTBP53611 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RABGGTBP53611 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RABGGTBP53611 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RABGGTBP53611 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RABGGTBP53611 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RABGGTBP53611 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RABGGTBP53611 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RABGGTBP53611 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RABGGTBP53611 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RABGGTBP53611 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RABGGTBP53611 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
RABGGTBP53611 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RABGGTBP53611 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RABGGTBP53611 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RABGGTBP53611 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
RABGGTBP53611 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RABGGTBP53611 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RABGGTBP53611 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RABGGTBP53611 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RABGGTBP53611 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RABGGTBP53611 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RABGGTBP53611 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RABGGTBP53611 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RABGGTBP53611 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RABGGTBP53611 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
RABGGTBP53611 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RABGGTBP53611 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RABGGTBP53611 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RABGGTBP53611 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RABGGTBP53611 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RABGGTBP53611 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RABGGTBP53611 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RABGGTBP53611 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RABGGTBP53611 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RABGGTBP53611 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RABGGTBP53611 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RABGGTBP53611 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RABGGTBP53611 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RABGGTBP53611 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RABGGTBP53611 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RABGGTBP53611 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RABGGTBP53611 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RABGGTBP53611 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RABGGTBP53611 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RABGGTBP53611 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RABGGTBP53611 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RABGGTBP53611 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RABGGTBP53611 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RABGGTBP53611 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RABGGTBP53611 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RABGGTBP53611 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
RABGGTBP53611 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RABGGTBP53611 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RABGGTBP53611 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RABGGTBP53611 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RABGGTBP53611 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
RABGGTBP53611 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RABGGTBP53611 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RABGGTBP53611 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RABGGTBP53611 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RABGGTBP53611 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RABGGTBP53611 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RABGGTBP53611 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RABGGTBP53611 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
RABGGTBP53611 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
RABGGTBP53611 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RABGGTBP53611 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RABGGTBP53611 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RABGGTBP53611 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RABGGTBP53611 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RABGGTBP53611 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RABGGTBP53611 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RABGGTBP53611 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RABGGTBP53611 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RABGGTBP53611 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RABGGTBP53611 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
RABGGTBP53611 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RABGGTBP53611 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RABGGTBP53611 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RABGGTBP53611 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RABGGTBP53611 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RABGGTBP53611 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.3 ms