Protein–RNA interactions for Protein: P49754

VPS41, Vacuolar protein sorting-associated protein 41 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS41P49754 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
VPS41P49754 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
VPS41P49754 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
VPS41P49754 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
VPS41P49754 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
VPS41P49754 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VPS41P49754 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
VPS41P49754 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VPS41P49754 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
VPS41P49754 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VPS41P49754 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VPS41P49754 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VPS41P49754 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
VPS41P49754 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
VPS41P49754 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
VPS41P49754 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
VPS41P49754 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
VPS41P49754 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
VPS41P49754 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VPS41P49754 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
VPS41P49754 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
VPS41P49754 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
VPS41P49754 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
VPS41P49754 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
VPS41P49754 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
VPS41P49754 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
VPS41P49754 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
VPS41P49754 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
VPS41P49754 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
VPS41P49754 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
VPS41P49754 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
VPS41P49754 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
VPS41P49754 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
VPS41P49754 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
VPS41P49754 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
VPS41P49754 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
VPS41P49754 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
VPS41P49754 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
VPS41P49754 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
VPS41P49754 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
VPS41P49754 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
VPS41P49754 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
VPS41P49754 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
VPS41P49754 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
VPS41P49754 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
VPS41P49754 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
VPS41P49754 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
VPS41P49754 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
VPS41P49754 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
VPS41P49754 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
VPS41P49754 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
VPS41P49754 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
VPS41P49754 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
VPS41P49754 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
VPS41P49754 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
VPS41P49754 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
VPS41P49754 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
VPS41P49754 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
VPS41P49754 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
VPS41P49754 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
VPS41P49754 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
VPS41P49754 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
VPS41P49754 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
VPS41P49754 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
VPS41P49754 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
VPS41P49754 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
VPS41P49754 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
VPS41P49754 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VPS41P49754 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VPS41P49754 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VPS41P49754 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
VPS41P49754 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
VPS41P49754 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
VPS41P49754 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
VPS41P49754 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
VPS41P49754 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
VPS41P49754 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
VPS41P49754 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
VPS41P49754 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
VPS41P49754 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
VPS41P49754 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
VPS41P49754 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
VPS41P49754 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
VPS41P49754 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
VPS41P49754 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
VPS41P49754 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
VPS41P49754 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
VPS41P49754 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
VPS41P49754 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
VPS41P49754 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
VPS41P49754 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
VPS41P49754 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
VPS41P49754 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
VPS41P49754 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VPS41P49754 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
VPS41P49754 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VPS41P49754 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
VPS41P49754 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
VPS41P49754 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
VPS41P49754 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms