Protein–RNA interactions for Protein: P45973

CBX5, Chromobox protein homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX5P45973 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CBX5P45973 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CBX5P45973 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CBX5P45973 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CBX5P45973 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CBX5P45973 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CBX5P45973 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CBX5P45973 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CBX5P45973 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CBX5P45973 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CBX5P45973 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CBX5P45973 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CBX5P45973 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CBX5P45973 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CBX5P45973 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CBX5P45973 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CBX5P45973 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CBX5P45973 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CBX5P45973 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CBX5P45973 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CBX5P45973 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CBX5P45973 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CBX5P45973 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CBX5P45973 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CBX5P45973 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CBX5P45973 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CBX5P45973 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CBX5P45973 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CBX5P45973 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CBX5P45973 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CBX5P45973 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CBX5P45973 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CBX5P45973 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CBX5P45973 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CBX5P45973 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CBX5P45973 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CBX5P45973 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CBX5P45973 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CBX5P45973 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CBX5P45973 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CBX5P45973 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CBX5P45973 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CBX5P45973 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CBX5P45973 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CBX5P45973 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CBX5P45973 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CBX5P45973 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CBX5P45973 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CBX5P45973 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CBX5P45973 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CBX5P45973 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CBX5P45973 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CBX5P45973 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CBX5P45973 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CBX5P45973 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CBX5P45973 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CBX5P45973 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CBX5P45973 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CBX5P45973 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CBX5P45973 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CBX5P45973 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CBX5P45973 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CBX5P45973 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CBX5P45973 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CBX5P45973 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CBX5P45973 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CBX5P45973 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CBX5P45973 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CBX5P45973 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CBX5P45973 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CBX5P45973 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CBX5P45973 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CBX5P45973 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CBX5P45973 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CBX5P45973 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CBX5P45973 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CBX5P45973 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CBX5P45973 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CBX5P45973 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CBX5P45973 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CBX5P45973 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CBX5P45973 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CBX5P45973 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CBX5P45973 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CBX5P45973 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CBX5P45973 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CBX5P45973 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CBX5P45973 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CBX5P45973 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CBX5P45973 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CBX5P45973 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CBX5P45973 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CBX5P45973 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CBX5P45973 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CBX5P45973 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CBX5P45973 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CBX5P45973 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CBX5P45973 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CBX5P45973 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CBX5P45973 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms