Protein–RNA interactions for Protein: P40306

PSMB10, Proteasome subunit beta type-10, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB10P40306 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMB10P40306 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMB10P40306 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMB10P40306 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMB10P40306 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMB10P40306 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMB10P40306 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMB10P40306 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMB10P40306 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMB10P40306 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMB10P40306 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMB10P40306 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMB10P40306 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMB10P40306 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMB10P40306 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMB10P40306 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMB10P40306 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMB10P40306 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMB10P40306 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMB10P40306 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMB10P40306 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMB10P40306 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMB10P40306 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMB10P40306 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMB10P40306 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMB10P40306 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMB10P40306 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMB10P40306 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMB10P40306 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMB10P40306 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMB10P40306 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMB10P40306 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMB10P40306 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMB10P40306 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMB10P40306 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSMB10P40306 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMB10P40306 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMB10P40306 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMB10P40306 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMB10P40306 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMB10P40306 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMB10P40306 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMB10P40306 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMB10P40306 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMB10P40306 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMB10P40306 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMB10P40306 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMB10P40306 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMB10P40306 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMB10P40306 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMB10P40306 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMB10P40306 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSMB10P40306 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSMB10P40306 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSMB10P40306 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSMB10P40306 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSMB10P40306 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSMB10P40306 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSMB10P40306 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSMB10P40306 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSMB10P40306 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSMB10P40306 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMB10P40306 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMB10P40306 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMB10P40306 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMB10P40306 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMB10P40306 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSMB10P40306 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSMB10P40306 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PSMB10P40306 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMB10P40306 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMB10P40306 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMB10P40306 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSMB10P40306 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PSMB10P40306 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PSMB10P40306 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PSMB10P40306 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PSMB10P40306 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMB10P40306 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMB10P40306 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMB10P40306 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMB10P40306 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSMB10P40306 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSMB10P40306 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSMB10P40306 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSMB10P40306 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMB10P40306 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMB10P40306 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMB10P40306 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSMB10P40306 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSMB10P40306 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSMB10P40306 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSMB10P40306 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSMB10P40306 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSMB10P40306 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMB10P40306 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMB10P40306 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMB10P40306 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMB10P40306 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMB10P40306 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms