Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM23P36406 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM23P36406 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRIM23P36406 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
TRIM23P36406 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM23P36406 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM23P36406 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM23P36406 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM23P36406 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM23P36406 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM23P36406 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM23P36406 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM23P36406 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM23P36406 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM23P36406 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM23P36406 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM23P36406 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM23P36406 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM23P36406 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM23P36406 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM23P36406 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM23P36406 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM23P36406 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM23P36406 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM23P36406 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM23P36406 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM23P36406 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM23P36406 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM23P36406 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM23P36406 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM23P36406 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM23P36406 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM23P36406 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM23P36406 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM23P36406 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM23P36406 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM23P36406 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM23P36406 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM23P36406 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM23P36406 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM23P36406 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM23P36406 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM23P36406 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM23P36406 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM23P36406 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM23P36406 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM23P36406 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM23P36406 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM23P36406 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM23P36406 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM23P36406 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM23P36406 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM23P36406 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM23P36406 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM23P36406 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM23P36406 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM23P36406 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM23P36406 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM23P36406 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM23P36406 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM23P36406 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM23P36406 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM23P36406 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM23P36406 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM23P36406 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM23P36406 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM23P36406 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM23P36406 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM23P36406 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM23P36406 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM23P36406 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM23P36406 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM23P36406 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM23P36406 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM23P36406 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM23P36406 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM23P36406 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM23P36406 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM23P36406 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM23P36406 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM23P36406 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM23P36406 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM23P36406 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM23P36406 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM23P36406 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM23P36406 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM23P36406 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM23P36406 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM23P36406 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM23P36406 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM23P36406 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM23P36406 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM23P36406 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM23P36406 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM23P36406 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM23P36406 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM23P36406 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM23P36406 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM23P36406 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM23P36406 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms