Protein–RNA interactions for Protein: P32297

CHRNA3, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA3P32297 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHRNA3P32297 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHRNA3P32297 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHRNA3P32297 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHRNA3P32297 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHRNA3P32297 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CHRNA3P32297 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CHRNA3P32297 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CHRNA3P32297 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CHRNA3P32297 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CHRNA3P32297 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CHRNA3P32297 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CHRNA3P32297 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CHRNA3P32297 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CHRNA3P32297 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CHRNA3P32297 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CHRNA3P32297 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CHRNA3P32297 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CHRNA3P32297 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CHRNA3P32297 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHRNA3P32297 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHRNA3P32297 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CHRNA3P32297 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHRNA3P32297 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHRNA3P32297 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHRNA3P32297 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CHRNA3P32297 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHRNA3P32297 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHRNA3P32297 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHRNA3P32297 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHRNA3P32297 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHRNA3P32297 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHRNA3P32297 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CHRNA3P32297 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHRNA3P32297 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHRNA3P32297 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHRNA3P32297 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CHRNA3P32297 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CHRNA3P32297 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CHRNA3P32297 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CHRNA3P32297 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHRNA3P32297 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHRNA3P32297 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHRNA3P32297 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CHRNA3P32297 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHRNA3P32297 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHRNA3P32297 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHRNA3P32297 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHRNA3P32297 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHRNA3P32297 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHRNA3P32297 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHRNA3P32297 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHRNA3P32297 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHRNA3P32297 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHRNA3P32297 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHRNA3P32297 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CHRNA3P32297 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CHRNA3P32297 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHRNA3P32297 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHRNA3P32297 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHRNA3P32297 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHRNA3P32297 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CHRNA3P32297 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CHRNA3P32297 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CHRNA3P32297 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CHRNA3P32297 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CHRNA3P32297 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHRNA3P32297 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHRNA3P32297 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHRNA3P32297 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHRNA3P32297 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHRNA3P32297 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHRNA3P32297 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHRNA3P32297 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CHRNA3P32297 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHRNA3P32297 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHRNA3P32297 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHRNA3P32297 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHRNA3P32297 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CHRNA3P32297 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
CHRNA3P32297 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CHRNA3P32297 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHRNA3P32297 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHRNA3P32297 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHRNA3P32297 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHRNA3P32297 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHRNA3P32297 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHRNA3P32297 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHRNA3P32297 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHRNA3P32297 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHRNA3P32297 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHRNA3P32297 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHRNA3P32297 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHRNA3P32297 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHRNA3P32297 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHRNA3P32297 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHRNA3P32297 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHRNA3P32297 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHRNA3P32297 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHRNA3P32297 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.9 ms