Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCKARP32238 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCKARP32238 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCKARP32238 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCKARP32238 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCKARP32238 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCKARP32238 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCKARP32238 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCKARP32238 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCKARP32238 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCKARP32238 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCKARP32238 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCKARP32238 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCKARP32238 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCKARP32238 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCKARP32238 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCKARP32238 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CCKARP32238 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCKARP32238 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCKARP32238 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCKARP32238 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCKARP32238 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCKARP32238 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCKARP32238 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCKARP32238 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCKARP32238 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCKARP32238 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCKARP32238 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCKARP32238 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCKARP32238 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCKARP32238 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCKARP32238 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCKARP32238 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCKARP32238 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCKARP32238 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
CCKARP32238 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CCKARP32238 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCKARP32238 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCKARP32238 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCKARP32238 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCKARP32238 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCKARP32238 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCKARP32238 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCKARP32238 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCKARP32238 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCKARP32238 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCKARP32238 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCKARP32238 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCKARP32238 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CCKARP32238 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCKARP32238 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCKARP32238 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCKARP32238 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCKARP32238 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCKARP32238 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CCKARP32238 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCKARP32238 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCKARP32238 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCKARP32238 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCKARP32238 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCKARP32238 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCKARP32238 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCKARP32238 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCKARP32238 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCKARP32238 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCKARP32238 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCKARP32238 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCKARP32238 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCKARP32238 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCKARP32238 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCKARP32238 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCKARP32238 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCKARP32238 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCKARP32238 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCKARP32238 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCKARP32238 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCKARP32238 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCKARP32238 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCKARP32238 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCKARP32238 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCKARP32238 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCKARP32238 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCKARP32238 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCKARP32238 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCKARP32238 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCKARP32238 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCKARP32238 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCKARP32238 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCKARP32238 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCKARP32238 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCKARP32238 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCKARP32238 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCKARP32238 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCKARP32238 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCKARP32238 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCKARP32238 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCKARP32238 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCKARP32238 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCKARP32238 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCKARP32238 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms