Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
HOXC13P31276 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
HOXC13P31276 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
HOXC13P31276 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HOXC13P31276 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HOXC13P31276 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HOXC13P31276 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HOXC13P31276 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HOXC13P31276 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HOXC13P31276 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HOXC13P31276 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HOXC13P31276 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HOXC13P31276 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HOXC13P31276 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
HOXC13P31276 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HOXC13P31276 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
HOXC13P31276 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HOXC13P31276 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HOXC13P31276 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HOXC13P31276 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HOXC13P31276 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HOXC13P31276 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HOXC13P31276 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HOXC13P31276 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HOXC13P31276 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HOXC13P31276 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HOXC13P31276 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HOXC13P31276 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HOXC13P31276 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HOXC13P31276 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HOXC13P31276 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HOXC13P31276 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HOXC13P31276 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HOXC13P31276 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
HOXC13P31276 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
HOXC13P31276 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HOXC13P31276 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HOXC13P31276 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
HOXC13P31276 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
HOXC13P31276 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HOXC13P31276 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HOXC13P31276 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HOXC13P31276 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.33■■□□□ 1.96
HOXC13P31276 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
HOXC13P31276 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
HOXC13P31276 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HOXC13P31276 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HOXC13P31276 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HOXC13P31276 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
HOXC13P31276 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HOXC13P31276 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HOXC13P31276 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HOXC13P31276 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HOXC13P31276 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HOXC13P31276 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HOXC13P31276 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HOXC13P31276 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HOXC13P31276 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HOXC13P31276 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HOXC13P31276 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HOXC13P31276 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HOXC13P31276 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HOXC13P31276 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
HOXC13P31276 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
HOXC13P31276 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
HOXC13P31276 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HOXC13P31276 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HOXC13P31276 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HOXC13P31276 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HOXC13P31276 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HOXC13P31276 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HOXC13P31276 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HOXC13P31276 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HOXC13P31276 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
HOXC13P31276 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
HOXC13P31276 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HOXC13P31276 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HOXC13P31276 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HOXC13P31276 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HOXC13P31276 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HOXC13P31276 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HOXC13P31276 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HOXC13P31276 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HOXC13P31276 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HOXC13P31276 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HOXC13P31276 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HOXC13P31276 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HOXC13P31276 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
HOXC13P31276 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HOXC13P31276 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HOXC13P31276 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HOXC13P31276 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HOXC13P31276 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HOXC13P31276 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
HOXC13P31276 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
HOXC13P31276 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HOXC13P31276 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HOXC13P31276 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HOXC13P31276 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HOXC13P31276 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms