Protein–RNA interactions for Protein: P24347

MMP11, Stromelysin-3, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP11P24347 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
MMP11P24347 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MMP11P24347 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MMP11P24347 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
MMP11P24347 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
MMP11P24347 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MMP11P24347 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
MMP11P24347 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MMP11P24347 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MMP11P24347 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MMP11P24347 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MMP11P24347 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MMP11P24347 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MMP11P24347 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MMP11P24347 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MMP11P24347 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MMP11P24347 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MMP11P24347 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MMP11P24347 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MMP11P24347 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MMP11P24347 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MMP11P24347 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
MMP11P24347 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MMP11P24347 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MMP11P24347 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MMP11P24347 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MMP11P24347 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MMP11P24347 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MMP11P24347 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MMP11P24347 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MMP11P24347 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
MMP11P24347 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MMP11P24347 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MMP11P24347 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MMP11P24347 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MMP11P24347 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MMP11P24347 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MMP11P24347 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MMP11P24347 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MMP11P24347 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MMP11P24347 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MMP11P24347 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MMP11P24347 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MMP11P24347 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MMP11P24347 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MMP11P24347 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MMP11P24347 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MMP11P24347 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MMP11P24347 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MMP11P24347 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MMP11P24347 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MMP11P24347 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MMP11P24347 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
MMP11P24347 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MMP11P24347 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MMP11P24347 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MMP11P24347 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MMP11P24347 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MMP11P24347 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MMP11P24347 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MMP11P24347 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MMP11P24347 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MMP11P24347 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MMP11P24347 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MMP11P24347 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MMP11P24347 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MMP11P24347 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MMP11P24347 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MMP11P24347 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MMP11P24347 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MMP11P24347 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
MMP11P24347 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
MMP11P24347 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MMP11P24347 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MMP11P24347 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MMP11P24347 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MMP11P24347 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MMP11P24347 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MMP11P24347 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MMP11P24347 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MMP11P24347 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MMP11P24347 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MMP11P24347 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MMP11P24347 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MMP11P24347 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MMP11P24347 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MMP11P24347 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MMP11P24347 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MMP11P24347 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MMP11P24347 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MMP11P24347 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MMP11P24347 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MMP11P24347 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MMP11P24347 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MMP11P24347 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MMP11P24347 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MMP11P24347 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MMP11P24347 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MMP11P24347 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MMP11P24347 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms