Protein–RNA interactions for Protein: P24046

GABRR1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit rho-1, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRR1P24046 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GABRR1P24046 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABRR1P24046 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABRR1P24046 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABRR1P24046 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GABRR1P24046 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GABRR1P24046 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABRR1P24046 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABRR1P24046 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GABRR1P24046 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GABRR1P24046 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GABRR1P24046 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GABRR1P24046 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GABRR1P24046 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GABRR1P24046 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GABRR1P24046 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GABRR1P24046 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GABRR1P24046 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GABRR1P24046 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GABRR1P24046 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GABRR1P24046 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABRR1P24046 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABRR1P24046 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABRR1P24046 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABRR1P24046 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABRR1P24046 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABRR1P24046 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABRR1P24046 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABRR1P24046 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABRR1P24046 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABRR1P24046 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABRR1P24046 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABRR1P24046 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABRR1P24046 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABRR1P24046 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABRR1P24046 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABRR1P24046 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABRR1P24046 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABRR1P24046 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GABRR1P24046 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABRR1P24046 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GABRR1P24046 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GABRR1P24046 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GABRR1P24046 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABRR1P24046 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABRR1P24046 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABRR1P24046 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABRR1P24046 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABRR1P24046 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABRR1P24046 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GABRR1P24046 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABRR1P24046 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABRR1P24046 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABRR1P24046 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABRR1P24046 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABRR1P24046 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABRR1P24046 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABRR1P24046 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GABRR1P24046 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABRR1P24046 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABRR1P24046 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABRR1P24046 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABRR1P24046 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRR1P24046 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRR1P24046 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRR1P24046 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRR1P24046 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRR1P24046 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRR1P24046 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRR1P24046 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRR1P24046 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRR1P24046 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRR1P24046 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABRR1P24046 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABRR1P24046 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABRR1P24046 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABRR1P24046 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GABRR1P24046 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABRR1P24046 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABRR1P24046 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABRR1P24046 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABRR1P24046 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABRR1P24046 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABRR1P24046 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABRR1P24046 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABRR1P24046 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABRR1P24046 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABRR1P24046 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABRR1P24046 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABRR1P24046 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABRR1P24046 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABRR1P24046 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABRR1P24046 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABRR1P24046 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GABRR1P24046 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GABRR1P24046 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GABRR1P24046 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GABRR1P24046 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GABRR1P24046 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GABRR1P24046 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms