Protein–RNA interactions for Protein: P23219

PTGS1, Prostaglandin G/H synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1P23219 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PTGS1P23219 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PTGS1P23219 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PTGS1P23219 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PTGS1P23219 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PTGS1P23219 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PTGS1P23219 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PTGS1P23219 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
PTGS1P23219 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PTGS1P23219 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PTGS1P23219 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PTGS1P23219 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PTGS1P23219 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PTGS1P23219 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PTGS1P23219 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PTGS1P23219 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PTGS1P23219 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC30.43■■■□□ 2.46
PTGS1P23219 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
PTGS1P23219 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PTGS1P23219 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
PTGS1P23219 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PTGS1P23219 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PTGS1P23219 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PTGS1P23219 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PTGS1P23219 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PTGS1P23219 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PTGS1P23219 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PTGS1P23219 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
PTGS1P23219 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
PTGS1P23219 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PTGS1P23219 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PTGS1P23219 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PTGS1P23219 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PTGS1P23219 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PTGS1P23219 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PTGS1P23219 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PTGS1P23219 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
PTGS1P23219 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PTGS1P23219 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PTGS1P23219 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
PTGS1P23219 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
PTGS1P23219 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PTGS1P23219 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PTGS1P23219 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PTGS1P23219 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PTGS1P23219 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PTGS1P23219 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PTGS1P23219 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PTGS1P23219 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PTGS1P23219 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PTGS1P23219 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PTGS1P23219 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PTGS1P23219 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PTGS1P23219 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PTGS1P23219 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PTGS1P23219 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PTGS1P23219 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PTGS1P23219 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PTGS1P23219 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PTGS1P23219 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
PTGS1P23219 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PTGS1P23219 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PTGS1P23219 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PTGS1P23219 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PTGS1P23219 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PTGS1P23219 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PTGS1P23219 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PTGS1P23219 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PTGS1P23219 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PTGS1P23219 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PTGS1P23219 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PTGS1P23219 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PTGS1P23219 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
PTGS1P23219 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PTGS1P23219 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PTGS1P23219 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PTGS1P23219 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PTGS1P23219 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PTGS1P23219 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
PTGS1P23219 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PTGS1P23219 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PTGS1P23219 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PTGS1P23219 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PTGS1P23219 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PTGS1P23219 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PTGS1P23219 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PTGS1P23219 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PTGS1P23219 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PTGS1P23219 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
PTGS1P23219 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PTGS1P23219 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PTGS1P23219 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PTGS1P23219 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PTGS1P23219 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PTGS1P23219 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PTGS1P23219 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PTGS1P23219 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PTGS1P23219 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PTGS1P23219 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PTGS1P23219 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms