Protein–RNA interactions for Protein: P22223

CDH3, Cadherin-3, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH3P22223 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDH3P22223 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CDH3P22223 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDH3P22223 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDH3P22223 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDH3P22223 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDH3P22223 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDH3P22223 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDH3P22223 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CDH3P22223 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDH3P22223 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDH3P22223 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDH3P22223 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDH3P22223 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDH3P22223 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDH3P22223 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDH3P22223 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDH3P22223 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDH3P22223 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDH3P22223 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDH3P22223 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDH3P22223 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDH3P22223 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDH3P22223 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDH3P22223 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDH3P22223 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CDH3P22223 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDH3P22223 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDH3P22223 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDH3P22223 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDH3P22223 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDH3P22223 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDH3P22223 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDH3P22223 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CDH3P22223 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDH3P22223 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDH3P22223 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDH3P22223 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDH3P22223 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDH3P22223 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDH3P22223 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDH3P22223 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDH3P22223 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDH3P22223 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDH3P22223 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDH3P22223 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CDH3P22223 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDH3P22223 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDH3P22223 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDH3P22223 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDH3P22223 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDH3P22223 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDH3P22223 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDH3P22223 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDH3P22223 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDH3P22223 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CDH3P22223 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDH3P22223 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDH3P22223 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDH3P22223 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CDH3P22223 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDH3P22223 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDH3P22223 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDH3P22223 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDH3P22223 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CDH3P22223 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDH3P22223 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDH3P22223 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDH3P22223 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDH3P22223 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDH3P22223 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDH3P22223 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDH3P22223 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDH3P22223 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CDH3P22223 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDH3P22223 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDH3P22223 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDH3P22223 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDH3P22223 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDH3P22223 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDH3P22223 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDH3P22223 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDH3P22223 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDH3P22223 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDH3P22223 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDH3P22223 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDH3P22223 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDH3P22223 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDH3P22223 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDH3P22223 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDH3P22223 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDH3P22223 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDH3P22223 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDH3P22223 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDH3P22223 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDH3P22223 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDH3P22223 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDH3P22223 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDH3P22223 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDH3P22223 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms