Protein–RNA interactions for Protein: P21695

GPD1, Glycerol-3-phosphate dehydrogenase [NAD(+)], cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPD1P21695 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GPD1P21695 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GPD1P21695 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
GPD1P21695 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GPD1P21695 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GPD1P21695 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GPD1P21695 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GPD1P21695 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GPD1P21695 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
GPD1P21695 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
GPD1P21695 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.54■■■□□ 2
GPD1P21695 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
GPD1P21695 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GPD1P21695 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
GPD1P21695 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
GPD1P21695 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.52■■■□□ 2
GPD1P21695 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
GPD1P21695 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GPD1P21695 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GPD1P21695 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GPD1P21695 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GPD1P21695 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GPD1P21695 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GPD1P21695 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GPD1P21695 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GPD1P21695 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GPD1P21695 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GPD1P21695 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GPD1P21695 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GPD1P21695 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GPD1P21695 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
GPD1P21695 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
GPD1P21695 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GPD1P21695 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GPD1P21695 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GPD1P21695 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GPD1P21695 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GPD1P21695 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GPD1P21695 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GPD1P21695 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GPD1P21695 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GPD1P21695 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GPD1P21695 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GPD1P21695 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GPD1P21695 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
GPD1P21695 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GPD1P21695 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GPD1P21695 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GPD1P21695 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GPD1P21695 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GPD1P21695 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GPD1P21695 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GPD1P21695 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GPD1P21695 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
GPD1P21695 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GPD1P21695 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
GPD1P21695 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GPD1P21695 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GPD1P21695 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GPD1P21695 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
GPD1P21695 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GPD1P21695 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GPD1P21695 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GPD1P21695 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GPD1P21695 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GPD1P21695 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GPD1P21695 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GPD1P21695 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GPD1P21695 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GPD1P21695 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GPD1P21695 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GPD1P21695 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GPD1P21695 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GPD1P21695 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GPD1P21695 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GPD1P21695 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GPD1P21695 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GPD1P21695 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GPD1P21695 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GPD1P21695 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GPD1P21695 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GPD1P21695 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GPD1P21695 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GPD1P21695 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GPD1P21695 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GPD1P21695 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GPD1P21695 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GPD1P21695 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GPD1P21695 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
GPD1P21695 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GPD1P21695 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
GPD1P21695 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GPD1P21695 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GPD1P21695 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GPD1P21695 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GPD1P21695 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GPD1P21695 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GPD1P21695 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
GPD1P21695 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GPD1P21695 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms