Protein–RNA interactions for Protein: P20338

RAB4A, Ras-related protein Rab-4A, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB4AP20338 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB4AP20338 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB4AP20338 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB4AP20338 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB4AP20338 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB4AP20338 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB4AP20338 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB4AP20338 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB4AP20338 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB4AP20338 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB4AP20338 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB4AP20338 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB4AP20338 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB4AP20338 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB4AP20338 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB4AP20338 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB4AP20338 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB4AP20338 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB4AP20338 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB4AP20338 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB4AP20338 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB4AP20338 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB4AP20338 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB4AP20338 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB4AP20338 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB4AP20338 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB4AP20338 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB4AP20338 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RAB4AP20338 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RAB4AP20338 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RAB4AP20338 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RAB4AP20338 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RAB4AP20338 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RAB4AP20338 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RAB4AP20338 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RAB4AP20338 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RAB4AP20338 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RAB4AP20338 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RAB4AP20338 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RAB4AP20338 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RAB4AP20338 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAB4AP20338 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAB4AP20338 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAB4AP20338 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAB4AP20338 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAB4AP20338 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAB4AP20338 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAB4AP20338 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAB4AP20338 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAB4AP20338 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB4AP20338 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB4AP20338 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB4AP20338 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB4AP20338 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RAB4AP20338 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RAB4AP20338 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RAB4AP20338 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RAB4AP20338 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RAB4AP20338 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RAB4AP20338 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RAB4AP20338 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RAB4AP20338 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RAB4AP20338 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RAB4AP20338 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RAB4AP20338 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RAB4AP20338 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RAB4AP20338 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RAB4AP20338 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RAB4AP20338 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RAB4AP20338 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RAB4AP20338 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RAB4AP20338 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RAB4AP20338 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RAB4AP20338 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RAB4AP20338 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
RAB4AP20338 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAB4AP20338 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAB4AP20338 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAB4AP20338 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAB4AP20338 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAB4AP20338 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAB4AP20338 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAB4AP20338 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAB4AP20338 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAB4AP20338 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAB4AP20338 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAB4AP20338 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAB4AP20338 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RAB4AP20338 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RAB4AP20338 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RAB4AP20338 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RAB4AP20338 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RAB4AP20338 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RAB4AP20338 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RAB4AP20338 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RAB4AP20338 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RAB4AP20338 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RAB4AP20338 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAB4AP20338 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAB4AP20338 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms