Protein–RNA interactions for Protein: P20226

TBP, TATA-box-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBPP20226 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TBPP20226 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TBPP20226 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TBPP20226 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TBPP20226 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TBPP20226 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TBPP20226 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TBPP20226 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TBPP20226 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TBPP20226 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TBPP20226 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TBPP20226 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TBPP20226 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TBPP20226 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TBPP20226 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TBPP20226 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TBPP20226 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TBPP20226 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TBPP20226 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TBPP20226 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TBPP20226 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TBPP20226 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TBPP20226 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TBPP20226 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TBPP20226 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TBPP20226 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TBPP20226 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TBPP20226 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TBPP20226 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TBPP20226 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TBPP20226 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TBPP20226 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TBPP20226 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TBPP20226 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TBPP20226 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TBPP20226 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TBPP20226 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TBPP20226 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TBPP20226 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TBPP20226 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TBPP20226 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TBPP20226 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TBPP20226 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TBPP20226 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TBPP20226 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TBPP20226 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TBPP20226 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TBPP20226 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TBPP20226 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TBPP20226 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TBPP20226 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TBPP20226 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TBPP20226 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TBPP20226 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TBPP20226 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TBPP20226 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TBPP20226 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TBPP20226 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TBPP20226 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TBPP20226 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TBPP20226 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TBPP20226 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TBPP20226 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TBPP20226 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TBPP20226 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TBPP20226 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TBPP20226 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TBPP20226 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TBPP20226 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TBPP20226 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TBPP20226 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TBPP20226 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TBPP20226 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TBPP20226 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TBPP20226 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TBPP20226 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TBPP20226 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TBPP20226 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TBPP20226 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TBPP20226 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TBPP20226 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TBPP20226 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TBPP20226 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TBPP20226 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TBPP20226 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TBPP20226 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TBPP20226 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TBPP20226 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TBPP20226 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TBPP20226 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TBPP20226 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TBPP20226 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TBPP20226 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TBPP20226 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TBPP20226 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TBPP20226 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TBPP20226 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TBPP20226 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TBPP20226 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TBPP20226 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.8 ms