Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRIM21P19474 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRIM21P19474 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRIM21P19474 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRIM21P19474 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
TRIM21P19474 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRIM21P19474 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRIM21P19474 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRIM21P19474 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRIM21P19474 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRIM21P19474 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRIM21P19474 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRIM21P19474 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRIM21P19474 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRIM21P19474 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRIM21P19474 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRIM21P19474 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRIM21P19474 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRIM21P19474 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRIM21P19474 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRIM21P19474 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRIM21P19474 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRIM21P19474 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRIM21P19474 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRIM21P19474 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRIM21P19474 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TRIM21P19474 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRIM21P19474 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRIM21P19474 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRIM21P19474 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRIM21P19474 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRIM21P19474 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRIM21P19474 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRIM21P19474 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRIM21P19474 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRIM21P19474 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRIM21P19474 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRIM21P19474 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRIM21P19474 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRIM21P19474 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRIM21P19474 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TRIM21P19474 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
TRIM21P19474 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRIM21P19474 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
TRIM21P19474 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRIM21P19474 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRIM21P19474 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRIM21P19474 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRIM21P19474 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRIM21P19474 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRIM21P19474 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRIM21P19474 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRIM21P19474 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRIM21P19474 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRIM21P19474 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRIM21P19474 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRIM21P19474 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRIM21P19474 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRIM21P19474 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRIM21P19474 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRIM21P19474 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
TRIM21P19474 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRIM21P19474 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
TRIM21P19474 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRIM21P19474 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRIM21P19474 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRIM21P19474 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRIM21P19474 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRIM21P19474 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRIM21P19474 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRIM21P19474 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRIM21P19474 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRIM21P19474 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRIM21P19474 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRIM21P19474 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
TRIM21P19474 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRIM21P19474 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRIM21P19474 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRIM21P19474 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRIM21P19474 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRIM21P19474 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
TRIM21P19474 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRIM21P19474 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRIM21P19474 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRIM21P19474 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
TRIM21P19474 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRIM21P19474 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
TRIM21P19474 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRIM21P19474 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRIM21P19474 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRIM21P19474 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
TRIM21P19474 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRIM21P19474 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRIM21P19474 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRIM21P19474 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
TRIM21P19474 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRIM21P19474 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRIM21P19474 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRIM21P19474 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRIM21P19474 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms