Protein–RNA interactions for Protein: P18084

ITGB5, Integrin beta-5, humanhuman

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB5P18084 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
ITGB5P18084 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
ITGB5P18084 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ITGB5P18084 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ITGB5P18084 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ITGB5P18084 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
ITGB5P18084 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ITGB5P18084 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ITGB5P18084 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ITGB5P18084 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
ITGB5P18084 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ITGB5P18084 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ITGB5P18084 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ITGB5P18084 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
ITGB5P18084 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ITGB5P18084 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ITGB5P18084 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ITGB5P18084 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ITGB5P18084 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ITGB5P18084 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
ITGB5P18084 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ITGB5P18084 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ITGB5P18084 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ITGB5P18084 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ITGB5P18084 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ITGB5P18084 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ITGB5P18084 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ITGB5P18084 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ITGB5P18084 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ITGB5P18084 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ITGB5P18084 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ITGB5P18084 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ITGB5P18084 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ITGB5P18084 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ITGB5P18084 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ITGB5P18084 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ITGB5P18084 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ITGB5P18084 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
ITGB5P18084 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ITGB5P18084 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ITGB5P18084 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ITGB5P18084 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ITGB5P18084 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ITGB5P18084 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ITGB5P18084 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ITGB5P18084 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ITGB5P18084 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ITGB5P18084 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ITGB5P18084 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ITGB5P18084 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ITGB5P18084 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ITGB5P18084 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ITGB5P18084 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ITGB5P18084 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ITGB5P18084 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ITGB5P18084 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ITGB5P18084 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ITGB5P18084 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ITGB5P18084 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ITGB5P18084 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ITGB5P18084 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ITGB5P18084 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ITGB5P18084 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ITGB5P18084 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ITGB5P18084 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
ITGB5P18084 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
ITGB5P18084 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ITGB5P18084 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ITGB5P18084 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ITGB5P18084 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ITGB5P18084 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ITGB5P18084 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ITGB5P18084 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ITGB5P18084 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ITGB5P18084 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ITGB5P18084 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
ITGB5P18084 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ITGB5P18084 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ITGB5P18084 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ITGB5P18084 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ITGB5P18084 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ITGB5P18084 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ITGB5P18084 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ITGB5P18084 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ITGB5P18084 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ITGB5P18084 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ITGB5P18084 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
ITGB5P18084 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
ITGB5P18084 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
ITGB5P18084 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
ITGB5P18084 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ITGB5P18084 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ITGB5P18084 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ITGB5P18084 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ITGB5P18084 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ITGB5P18084 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ITGB5P18084 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ITGB5P18084 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ITGB5P18084 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ITGB5P18084 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.4 ms