Protein–RNA interactions for Protein: P16949

STMN1, Stathmin, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STMN1P16949 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
STMN1P16949 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
STMN1P16949 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
STMN1P16949 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
STMN1P16949 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
STMN1P16949 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
STMN1P16949 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
STMN1P16949 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
STMN1P16949 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
STMN1P16949 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
STMN1P16949 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
STMN1P16949 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
STMN1P16949 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
STMN1P16949 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
STMN1P16949 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
STMN1P16949 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
STMN1P16949 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
STMN1P16949 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
STMN1P16949 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
STMN1P16949 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
STMN1P16949 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
STMN1P16949 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
STMN1P16949 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
STMN1P16949 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
STMN1P16949 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
STMN1P16949 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
STMN1P16949 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
STMN1P16949 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
STMN1P16949 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
STMN1P16949 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
STMN1P16949 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
STMN1P16949 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
STMN1P16949 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
STMN1P16949 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
STMN1P16949 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
STMN1P16949 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
STMN1P16949 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
STMN1P16949 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
STMN1P16949 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
STMN1P16949 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
STMN1P16949 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
STMN1P16949 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
STMN1P16949 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
STMN1P16949 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
STMN1P16949 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
STMN1P16949 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
STMN1P16949 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
STMN1P16949 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
STMN1P16949 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
STMN1P16949 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
STMN1P16949 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
STMN1P16949 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
STMN1P16949 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
STMN1P16949 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
STMN1P16949 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
STMN1P16949 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
STMN1P16949 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
STMN1P16949 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
STMN1P16949 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
STMN1P16949 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
STMN1P16949 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
STMN1P16949 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
STMN1P16949 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
STMN1P16949 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
STMN1P16949 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
STMN1P16949 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
STMN1P16949 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
STMN1P16949 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
STMN1P16949 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
STMN1P16949 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
STMN1P16949 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
STMN1P16949 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
STMN1P16949 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
STMN1P16949 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
STMN1P16949 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
STMN1P16949 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
STMN1P16949 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
STMN1P16949 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
STMN1P16949 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
STMN1P16949 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
STMN1P16949 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
STMN1P16949 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
STMN1P16949 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
STMN1P16949 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
STMN1P16949 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
STMN1P16949 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
STMN1P16949 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
STMN1P16949 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
STMN1P16949 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
STMN1P16949 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
STMN1P16949 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
STMN1P16949 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
STMN1P16949 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
STMN1P16949 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
STMN1P16949 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
STMN1P16949 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
STMN1P16949 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
STMN1P16949 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
STMN1P16949 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
STMN1P16949 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms