Protein–RNA interactions for Protein: P13611

VCAN, Versican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCANP13611 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
VCANP13611 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
VCANP13611 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.11
VCANP13611 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
VCANP13611 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
VCANP13611 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
VCANP13611 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
VCANP13611 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
VCANP13611 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
VCANP13611 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
VCANP13611 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
VCANP13611 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
VCANP13611 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
VCANP13611 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
VCANP13611 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
VCANP13611 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
VCANP13611 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
VCANP13611 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
VCANP13611 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
VCANP13611 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
VCANP13611 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
VCANP13611 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
VCANP13611 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
VCANP13611 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
VCANP13611 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
VCANP13611 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
VCANP13611 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
VCANP13611 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
VCANP13611 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
VCANP13611 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
VCANP13611 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
VCANP13611 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
VCANP13611 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
VCANP13611 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
VCANP13611 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
VCANP13611 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
VCANP13611 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
VCANP13611 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
VCANP13611 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
VCANP13611 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
VCANP13611 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
VCANP13611 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
VCANP13611 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
VCANP13611 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
VCANP13611 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
VCANP13611 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
VCANP13611 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
VCANP13611 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
VCANP13611 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
VCANP13611 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
VCANP13611 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
VCANP13611 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
VCANP13611 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
VCANP13611 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
VCANP13611 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
VCANP13611 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
VCANP13611 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
VCANP13611 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
VCANP13611 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
VCANP13611 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
VCANP13611 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
VCANP13611 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
VCANP13611 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
VCANP13611 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
VCANP13611 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
VCANP13611 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
VCANP13611 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
VCANP13611 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
VCANP13611 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
VCANP13611 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
VCANP13611 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
VCANP13611 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
VCANP13611 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
VCANP13611 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
VCANP13611 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
VCANP13611 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
VCANP13611 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
VCANP13611 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
VCANP13611 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
VCANP13611 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
VCANP13611 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
VCANP13611 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
VCANP13611 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
VCANP13611 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
VCANP13611 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
VCANP13611 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
VCANP13611 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
VCANP13611 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
VCANP13611 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
VCANP13611 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
VCANP13611 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
VCANP13611 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
VCANP13611 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
VCANP13611 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
VCANP13611 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
VCANP13611 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
VCANP13611 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
VCANP13611 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
VCANP13611 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
VCANP13611 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms