Protein–RNA interactions for Protein: P12277

CKB, Creatine kinase B-type, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKBP12277 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CKBP12277 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CKBP12277 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CKBP12277 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CKBP12277 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CKBP12277 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CKBP12277 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CKBP12277 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CKBP12277 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
CKBP12277 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
CKBP12277 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
CKBP12277 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
CKBP12277 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
CKBP12277 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
CKBP12277 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
CKBP12277 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
CKBP12277 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
CKBP12277 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CKBP12277 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CKBP12277 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CKBP12277 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CKBP12277 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CKBP12277 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CKBP12277 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CKBP12277 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CKBP12277 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CKBP12277 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CKBP12277 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CKBP12277 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CKBP12277 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CKBP12277 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CKBP12277 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CKBP12277 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CKBP12277 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CKBP12277 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CKBP12277 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CKBP12277 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CKBP12277 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CKBP12277 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CKBP12277 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CKBP12277 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CKBP12277 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CKBP12277 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CKBP12277 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CKBP12277 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CKBP12277 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CKBP12277 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CKBP12277 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CKBP12277 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CKBP12277 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CKBP12277 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CKBP12277 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CKBP12277 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CKBP12277 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CKBP12277 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CKBP12277 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CKBP12277 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CKBP12277 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CKBP12277 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CKBP12277 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CKBP12277 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CKBP12277 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CKBP12277 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CKBP12277 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CKBP12277 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CKBP12277 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CKBP12277 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CKBP12277 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
CKBP12277 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CKBP12277 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CKBP12277 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CKBP12277 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CKBP12277 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CKBP12277 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CKBP12277 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CKBP12277 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CKBP12277 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CKBP12277 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CKBP12277 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CKBP12277 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CKBP12277 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CKBP12277 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
CKBP12277 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CKBP12277 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CKBP12277 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CKBP12277 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CKBP12277 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CKBP12277 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CKBP12277 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CKBP12277 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CKBP12277 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CKBP12277 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CKBP12277 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CKBP12277 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CKBP12277 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CKBP12277 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CKBP12277 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CKBP12277 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CKBP12277 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CKBP12277 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.9 ms