Protein–RNA interactions for Protein: P12081

HARS, Histidine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HARSP12081 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
HARSP12081 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
HARSP12081 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
HARSP12081 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
HARSP12081 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
HARSP12081 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
HARSP12081 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
HARSP12081 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
HARSP12081 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
HARSP12081 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HARSP12081 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
HARSP12081 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
HARSP12081 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HARSP12081 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
HARSP12081 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HARSP12081 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HARSP12081 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HARSP12081 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HARSP12081 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HARSP12081 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HARSP12081 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HARSP12081 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HARSP12081 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
HARSP12081 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
HARSP12081 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HARSP12081 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HARSP12081 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
HARSP12081 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
HARSP12081 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HARSP12081 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
HARSP12081 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
HARSP12081 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
HARSP12081 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HARSP12081 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
HARSP12081 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
HARSP12081 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
HARSP12081 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
HARSP12081 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
HARSP12081 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
HARSP12081 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
HARSP12081 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
HARSP12081 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
HARSP12081 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
HARSP12081 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
HARSP12081 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
HARSP12081 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
HARSP12081 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
HARSP12081 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
HARSP12081 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
HARSP12081 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
HARSP12081 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
HARSP12081 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
HARSP12081 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
HARSP12081 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
HARSP12081 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
HARSP12081 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
HARSP12081 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
HARSP12081 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
HARSP12081 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
HARSP12081 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
HARSP12081 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
HARSP12081 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HARSP12081 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HARSP12081 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HARSP12081 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
HARSP12081 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HARSP12081 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
HARSP12081 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HARSP12081 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
HARSP12081 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HARSP12081 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
HARSP12081 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
HARSP12081 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
HARSP12081 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
HARSP12081 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
HARSP12081 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
HARSP12081 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
HARSP12081 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HARSP12081 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HARSP12081 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HARSP12081 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HARSP12081 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
HARSP12081 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
HARSP12081 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
HARSP12081 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
HARSP12081 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
HARSP12081 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
HARSP12081 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
HARSP12081 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HARSP12081 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
HARSP12081 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HARSP12081 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HARSP12081 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
HARSP12081 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
HARSP12081 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HARSP12081 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
HARSP12081 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
HARSP12081 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HARSP12081 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HARSP12081 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms