Protein–RNA interactions for Protein: P10253

GAA, Lysosomal alpha-glucosidase, humanhuman

Predictions only

Length 952 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAAP10253 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GAAP10253 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GAAP10253 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GAAP10253 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GAAP10253 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GAAP10253 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GAAP10253 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GAAP10253 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GAAP10253 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GAAP10253 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GAAP10253 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GAAP10253 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GAAP10253 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GAAP10253 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GAAP10253 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GAAP10253 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GAAP10253 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GAAP10253 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GAAP10253 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GAAP10253 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
GAAP10253 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GAAP10253 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GAAP10253 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GAAP10253 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GAAP10253 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GAAP10253 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GAAP10253 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GAAP10253 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GAAP10253 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GAAP10253 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GAAP10253 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GAAP10253 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GAAP10253 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GAAP10253 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GAAP10253 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GAAP10253 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GAAP10253 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GAAP10253 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GAAP10253 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GAAP10253 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GAAP10253 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GAAP10253 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GAAP10253 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GAAP10253 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GAAP10253 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GAAP10253 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GAAP10253 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GAAP10253 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GAAP10253 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GAAP10253 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GAAP10253 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GAAP10253 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GAAP10253 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GAAP10253 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GAAP10253 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GAAP10253 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GAAP10253 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GAAP10253 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GAAP10253 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GAAP10253 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GAAP10253 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GAAP10253 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GAAP10253 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GAAP10253 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GAAP10253 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GAAP10253 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GAAP10253 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GAAP10253 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GAAP10253 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GAAP10253 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GAAP10253 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GAAP10253 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GAAP10253 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GAAP10253 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GAAP10253 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GAAP10253 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
GAAP10253 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GAAP10253 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GAAP10253 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GAAP10253 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GAAP10253 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GAAP10253 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GAAP10253 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GAAP10253 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GAAP10253 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GAAP10253 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GAAP10253 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GAAP10253 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GAAP10253 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GAAP10253 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GAAP10253 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GAAP10253 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GAAP10253 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GAAP10253 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GAAP10253 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GAAP10253 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GAAP10253 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GAAP10253 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GAAP10253 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GAAP10253 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms