Protein–RNA interactions for Protein: P02746

C1QB, Complement C1q subcomponent subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QBP02746 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1QBP02746 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1QBP02746 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1QBP02746 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1QBP02746 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1QBP02746 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1QBP02746 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1QBP02746 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1QBP02746 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1QBP02746 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1QBP02746 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1QBP02746 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1QBP02746 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1QBP02746 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
C1QBP02746 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1QBP02746 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1QBP02746 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1QBP02746 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1QBP02746 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1QBP02746 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1QBP02746 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
C1QBP02746 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1QBP02746 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1QBP02746 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1QBP02746 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1QBP02746 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1QBP02746 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1QBP02746 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1QBP02746 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1QBP02746 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1QBP02746 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1QBP02746 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1QBP02746 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C1QBP02746 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C1QBP02746 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C1QBP02746 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C1QBP02746 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C1QBP02746 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C1QBP02746 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C1QBP02746 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1QBP02746 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1QBP02746 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1QBP02746 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1QBP02746 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1QBP02746 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1QBP02746 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1QBP02746 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1QBP02746 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1QBP02746 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1QBP02746 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1QBP02746 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1QBP02746 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1QBP02746 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1QBP02746 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1QBP02746 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1QBP02746 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1QBP02746 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1QBP02746 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1QBP02746 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1QBP02746 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1QBP02746 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1QBP02746 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1QBP02746 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1QBP02746 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1QBP02746 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1QBP02746 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1QBP02746 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1QBP02746 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1QBP02746 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1QBP02746 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1QBP02746 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1QBP02746 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1QBP02746 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1QBP02746 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1QBP02746 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1QBP02746 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1QBP02746 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1QBP02746 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1QBP02746 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1QBP02746 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1QBP02746 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1QBP02746 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1QBP02746 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1QBP02746 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1QBP02746 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1QBP02746 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1QBP02746 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1QBP02746 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1QBP02746 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1QBP02746 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1QBP02746 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1QBP02746 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1QBP02746 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1QBP02746 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1QBP02746 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1QBP02746 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1QBP02746 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1QBP02746 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1QBP02746 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1QBP02746 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms