Protein–RNA interactions for Protein: O95428

PAPLN, Papilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPLNO95428 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
PAPLNO95428 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
PAPLNO95428 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
PAPLNO95428 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PAPLNO95428 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PAPLNO95428 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PAPLNO95428 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PAPLNO95428 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PAPLNO95428 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PAPLNO95428 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PAPLNO95428 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PAPLNO95428 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PAPLNO95428 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PAPLNO95428 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PAPLNO95428 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PAPLNO95428 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PAPLNO95428 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PAPLNO95428 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PAPLNO95428 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PAPLNO95428 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PAPLNO95428 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PAPLNO95428 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PAPLNO95428 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PAPLNO95428 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PAPLNO95428 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PAPLNO95428 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PAPLNO95428 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PAPLNO95428 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PAPLNO95428 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PAPLNO95428 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PAPLNO95428 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PAPLNO95428 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PAPLNO95428 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PAPLNO95428 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
PAPLNO95428 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PAPLNO95428 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PAPLNO95428 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PAPLNO95428 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PAPLNO95428 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PAPLNO95428 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PAPLNO95428 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PAPLNO95428 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PAPLNO95428 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PAPLNO95428 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PAPLNO95428 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PAPLNO95428 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PAPLNO95428 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PAPLNO95428 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PAPLNO95428 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PAPLNO95428 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PAPLNO95428 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PAPLNO95428 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PAPLNO95428 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PAPLNO95428 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PAPLNO95428 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PAPLNO95428 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PAPLNO95428 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PAPLNO95428 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PAPLNO95428 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PAPLNO95428 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PAPLNO95428 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PAPLNO95428 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PAPLNO95428 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PAPLNO95428 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PAPLNO95428 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PAPLNO95428 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PAPLNO95428 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PAPLNO95428 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PAPLNO95428 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PAPLNO95428 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PAPLNO95428 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PAPLNO95428 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
PAPLNO95428 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PAPLNO95428 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PAPLNO95428 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PAPLNO95428 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PAPLNO95428 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PAPLNO95428 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PAPLNO95428 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PAPLNO95428 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PAPLNO95428 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PAPLNO95428 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PAPLNO95428 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PAPLNO95428 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PAPLNO95428 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PAPLNO95428 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PAPLNO95428 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PAPLNO95428 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PAPLNO95428 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PAPLNO95428 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PAPLNO95428 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PAPLNO95428 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PAPLNO95428 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PAPLNO95428 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PAPLNO95428 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PAPLNO95428 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PAPLNO95428 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PAPLNO95428 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PAPLNO95428 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PAPLNO95428 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms