Protein–RNA interactions for Protein: O95425

SVIL, Supervillin, humanhuman

Predictions only

Length 2,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVILO95425 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SVILO95425 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SVILO95425 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SVILO95425 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SVILO95425 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SVILO95425 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SVILO95425 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SVILO95425 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SVILO95425 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SVILO95425 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SVILO95425 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SVILO95425 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SVILO95425 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SVILO95425 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SVILO95425 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SVILO95425 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SVILO95425 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SVILO95425 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SVILO95425 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SVILO95425 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SVILO95425 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SVILO95425 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SVILO95425 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SVILO95425 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SVILO95425 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SVILO95425 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SVILO95425 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SVILO95425 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SVILO95425 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SVILO95425 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SVILO95425 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SVILO95425 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SVILO95425 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SVILO95425 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SVILO95425 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SVILO95425 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SVILO95425 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SVILO95425 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SVILO95425 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SVILO95425 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SVILO95425 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SVILO95425 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SVILO95425 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SVILO95425 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SVILO95425 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SVILO95425 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SVILO95425 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SVILO95425 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SVILO95425 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SVILO95425 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SVILO95425 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SVILO95425 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SVILO95425 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SVILO95425 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SVILO95425 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SVILO95425 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SVILO95425 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SVILO95425 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SVILO95425 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SVILO95425 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SVILO95425 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SVILO95425 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SVILO95425 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SVILO95425 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SVILO95425 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SVILO95425 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SVILO95425 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SVILO95425 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SVILO95425 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SVILO95425 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SVILO95425 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SVILO95425 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SVILO95425 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SVILO95425 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SVILO95425 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SVILO95425 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SVILO95425 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SVILO95425 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SVILO95425 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SVILO95425 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SVILO95425 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SVILO95425 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SVILO95425 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SVILO95425 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SVILO95425 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SVILO95425 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SVILO95425 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SVILO95425 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SVILO95425 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SVILO95425 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SVILO95425 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SVILO95425 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SVILO95425 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SVILO95425 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SVILO95425 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SVILO95425 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SVILO95425 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SVILO95425 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SVILO95425 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SVILO95425 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms