Protein–RNA interactions for Protein: O94889

KLHL18, Kelch-like protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL18O94889 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KLHL18O94889 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KLHL18O94889 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
KLHL18O94889 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLHL18O94889 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLHL18O94889 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KLHL18O94889 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KLHL18O94889 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KLHL18O94889 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KLHL18O94889 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KLHL18O94889 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KLHL18O94889 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLHL18O94889 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLHL18O94889 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLHL18O94889 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KLHL18O94889 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KLHL18O94889 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KLHL18O94889 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLHL18O94889 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLHL18O94889 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
KLHL18O94889 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLHL18O94889 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLHL18O94889 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLHL18O94889 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KLHL18O94889 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KLHL18O94889 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KLHL18O94889 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHL18O94889 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHL18O94889 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHL18O94889 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHL18O94889 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KLHL18O94889 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KLHL18O94889 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHL18O94889 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHL18O94889 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHL18O94889 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KLHL18O94889 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KLHL18O94889 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KLHL18O94889 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KLHL18O94889 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KLHL18O94889 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KLHL18O94889 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KLHL18O94889 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KLHL18O94889 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KLHL18O94889 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KLHL18O94889 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KLHL18O94889 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KLHL18O94889 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
KLHL18O94889 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KLHL18O94889 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KLHL18O94889 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KLHL18O94889 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KLHL18O94889 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KLHL18O94889 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KLHL18O94889 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KLHL18O94889 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KLHL18O94889 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KLHL18O94889 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KLHL18O94889 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KLHL18O94889 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KLHL18O94889 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KLHL18O94889 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KLHL18O94889 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KLHL18O94889 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KLHL18O94889 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KLHL18O94889 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KLHL18O94889 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KLHL18O94889 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KLHL18O94889 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KLHL18O94889 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KLHL18O94889 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KLHL18O94889 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
KLHL18O94889 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KLHL18O94889 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KLHL18O94889 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KLHL18O94889 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KLHL18O94889 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
KLHL18O94889 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KLHL18O94889 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KLHL18O94889 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KLHL18O94889 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KLHL18O94889 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KLHL18O94889 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KLHL18O94889 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KLHL18O94889 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KLHL18O94889 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
KLHL18O94889 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KLHL18O94889 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KLHL18O94889 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KLHL18O94889 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KLHL18O94889 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KLHL18O94889 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KLHL18O94889 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KLHL18O94889 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KLHL18O94889 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KLHL18O94889 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KLHL18O94889 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KLHL18O94889 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KLHL18O94889 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KLHL18O94889 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms