Protein–RNA interactions for Protein: O75628

REM1, GTP-binding protein REM 1, humanhuman

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REM1O75628 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
REM1O75628 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
REM1O75628 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
REM1O75628 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
REM1O75628 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
REM1O75628 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
REM1O75628 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
REM1O75628 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
REM1O75628 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
REM1O75628 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
REM1O75628 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
REM1O75628 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
REM1O75628 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
REM1O75628 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
REM1O75628 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
REM1O75628 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
REM1O75628 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
REM1O75628 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
REM1O75628 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
REM1O75628 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
REM1O75628 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
REM1O75628 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
REM1O75628 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
REM1O75628 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
REM1O75628 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
REM1O75628 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
REM1O75628 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
REM1O75628 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
REM1O75628 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
REM1O75628 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
REM1O75628 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
REM1O75628 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
REM1O75628 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
REM1O75628 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
REM1O75628 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
REM1O75628 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
REM1O75628 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
REM1O75628 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
REM1O75628 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
REM1O75628 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
REM1O75628 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
REM1O75628 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
REM1O75628 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
REM1O75628 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
REM1O75628 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
REM1O75628 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
REM1O75628 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
REM1O75628 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
REM1O75628 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
REM1O75628 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
REM1O75628 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
REM1O75628 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
REM1O75628 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
REM1O75628 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
REM1O75628 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
REM1O75628 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
REM1O75628 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
REM1O75628 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
REM1O75628 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
REM1O75628 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
REM1O75628 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
REM1O75628 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
REM1O75628 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
REM1O75628 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
REM1O75628 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
REM1O75628 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
REM1O75628 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
REM1O75628 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
REM1O75628 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
REM1O75628 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
REM1O75628 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
REM1O75628 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
REM1O75628 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
REM1O75628 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
REM1O75628 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
REM1O75628 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
REM1O75628 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
REM1O75628 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
REM1O75628 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
REM1O75628 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
REM1O75628 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
REM1O75628 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
REM1O75628 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
REM1O75628 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
REM1O75628 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
REM1O75628 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
REM1O75628 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
REM1O75628 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
REM1O75628 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
REM1O75628 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
REM1O75628 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
REM1O75628 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
REM1O75628 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
REM1O75628 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
REM1O75628 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
REM1O75628 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
REM1O75628 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
REM1O75628 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
REM1O75628 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
REM1O75628 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms