Protein–RNA interactions for Protein: O75333

TBX10, T-box transcription factor TBX10, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBX10O75333 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TBX10O75333 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TBX10O75333 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TBX10O75333 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TBX10O75333 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TBX10O75333 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TBX10O75333 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
TBX10O75333 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
TBX10O75333 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TBX10O75333 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TBX10O75333 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
TBX10O75333 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
TBX10O75333 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
TBX10O75333 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
TBX10O75333 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
TBX10O75333 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
TBX10O75333 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
TBX10O75333 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
TBX10O75333 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
TBX10O75333 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TBX10O75333 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TBX10O75333 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TBX10O75333 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TBX10O75333 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TBX10O75333 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TBX10O75333 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TBX10O75333 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TBX10O75333 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TBX10O75333 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TBX10O75333 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TBX10O75333 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TBX10O75333 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TBX10O75333 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TBX10O75333 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TBX10O75333 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TBX10O75333 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
TBX10O75333 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TBX10O75333 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TBX10O75333 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TBX10O75333 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TBX10O75333 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TBX10O75333 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TBX10O75333 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TBX10O75333 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TBX10O75333 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TBX10O75333 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TBX10O75333 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TBX10O75333 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TBX10O75333 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TBX10O75333 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TBX10O75333 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TBX10O75333 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TBX10O75333 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TBX10O75333 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TBX10O75333 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
TBX10O75333 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TBX10O75333 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TBX10O75333 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
TBX10O75333 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TBX10O75333 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TBX10O75333 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TBX10O75333 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TBX10O75333 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TBX10O75333 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TBX10O75333 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TBX10O75333 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TBX10O75333 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TBX10O75333 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TBX10O75333 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TBX10O75333 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TBX10O75333 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TBX10O75333 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TBX10O75333 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TBX10O75333 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TBX10O75333 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TBX10O75333 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TBX10O75333 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TBX10O75333 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TBX10O75333 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TBX10O75333 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TBX10O75333 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TBX10O75333 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TBX10O75333 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TBX10O75333 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TBX10O75333 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TBX10O75333 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TBX10O75333 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TBX10O75333 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
TBX10O75333 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TBX10O75333 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TBX10O75333 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TBX10O75333 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TBX10O75333 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TBX10O75333 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
TBX10O75333 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TBX10O75333 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TBX10O75333 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TBX10O75333 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TBX10O75333 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TBX10O75333 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms