Protein–RNA interactions for Protein: O75167

PHACTR2, Phosphatase and actin regulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR2O75167 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PHACTR2O75167 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PHACTR2O75167 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PHACTR2O75167 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PHACTR2O75167 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PHACTR2O75167 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PHACTR2O75167 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PHACTR2O75167 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PHACTR2O75167 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
PHACTR2O75167 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PHACTR2O75167 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PHACTR2O75167 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PHACTR2O75167 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PHACTR2O75167 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
PHACTR2O75167 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PHACTR2O75167 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PHACTR2O75167 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PHACTR2O75167 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PHACTR2O75167 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PHACTR2O75167 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PHACTR2O75167 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PHACTR2O75167 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PHACTR2O75167 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PHACTR2O75167 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PHACTR2O75167 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PHACTR2O75167 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
PHACTR2O75167 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PHACTR2O75167 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PHACTR2O75167 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PHACTR2O75167 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
PHACTR2O75167 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PHACTR2O75167 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
PHACTR2O75167 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PHACTR2O75167 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PHACTR2O75167 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PHACTR2O75167 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PHACTR2O75167 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PHACTR2O75167 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PHACTR2O75167 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PHACTR2O75167 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PHACTR2O75167 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PHACTR2O75167 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PHACTR2O75167 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PHACTR2O75167 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PHACTR2O75167 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PHACTR2O75167 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PHACTR2O75167 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PHACTR2O75167 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PHACTR2O75167 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PHACTR2O75167 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PHACTR2O75167 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PHACTR2O75167 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
PHACTR2O75167 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PHACTR2O75167 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PHACTR2O75167 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PHACTR2O75167 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PHACTR2O75167 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PHACTR2O75167 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
PHACTR2O75167 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PHACTR2O75167 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PHACTR2O75167 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PHACTR2O75167 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PHACTR2O75167 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
PHACTR2O75167 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PHACTR2O75167 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
PHACTR2O75167 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PHACTR2O75167 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PHACTR2O75167 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PHACTR2O75167 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PHACTR2O75167 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PHACTR2O75167 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PHACTR2O75167 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PHACTR2O75167 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PHACTR2O75167 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PHACTR2O75167 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PHACTR2O75167 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PHACTR2O75167 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PHACTR2O75167 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PHACTR2O75167 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PHACTR2O75167 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PHACTR2O75167 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PHACTR2O75167 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PHACTR2O75167 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PHACTR2O75167 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PHACTR2O75167 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
PHACTR2O75167 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PHACTR2O75167 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PHACTR2O75167 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PHACTR2O75167 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
PHACTR2O75167 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PHACTR2O75167 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PHACTR2O75167 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PHACTR2O75167 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PHACTR2O75167 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PHACTR2O75167 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PHACTR2O75167 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PHACTR2O75167 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PHACTR2O75167 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PHACTR2O75167 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PHACTR2O75167 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms