Protein–RNA interactions for Protein: O75054

IGSF3, Immunoglobulin superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF3O75054 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
IGSF3O75054 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
IGSF3O75054 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
IGSF3O75054 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.69
IGSF3O75054 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
IGSF3O75054 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
IGSF3O75054 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
IGSF3O75054 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
IGSF3O75054 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
IGSF3O75054 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
IGSF3O75054 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
IGSF3O75054 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
IGSF3O75054 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
IGSF3O75054 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
IGSF3O75054 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
IGSF3O75054 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
IGSF3O75054 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
IGSF3O75054 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.68
IGSF3O75054 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.68
IGSF3O75054 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC31.76■■■□□ 2.67
IGSF3O75054 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
IGSF3O75054 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
IGSF3O75054 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
IGSF3O75054 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
IGSF3O75054 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
IGSF3O75054 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC31.74■■■□□ 2.67
IGSF3O75054 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
IGSF3O75054 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
IGSF3O75054 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC31.72■■■□□ 2.67
IGSF3O75054 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
IGSF3O75054 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.72■■■□□ 2.67
IGSF3O75054 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
IGSF3O75054 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
IGSF3O75054 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
IGSF3O75054 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
IGSF3O75054 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC31.69■■■□□ 2.66
IGSF3O75054 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
IGSF3O75054 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
IGSF3O75054 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
IGSF3O75054 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
IGSF3O75054 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
IGSF3O75054 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
IGSF3O75054 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC31.67■■■□□ 2.66
IGSF3O75054 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC31.66■■■□□ 2.66
IGSF3O75054 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
IGSF3O75054 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
IGSF3O75054 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
IGSF3O75054 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
IGSF3O75054 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
IGSF3O75054 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
IGSF3O75054 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
IGSF3O75054 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
IGSF3O75054 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
IGSF3O75054 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
IGSF3O75054 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
IGSF3O75054 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
IGSF3O75054 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
IGSF3O75054 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
IGSF3O75054 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
IGSF3O75054 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
IGSF3O75054 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
IGSF3O75054 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC31.58■■■□□ 2.65
IGSF3O75054 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
IGSF3O75054 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
IGSF3O75054 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
IGSF3O75054 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC31.58■■■□□ 2.65
IGSF3O75054 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
IGSF3O75054 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
IGSF3O75054 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC31.56■■■□□ 2.64
IGSF3O75054 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
IGSF3O75054 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
IGSF3O75054 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
IGSF3O75054 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
IGSF3O75054 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
IGSF3O75054 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
IGSF3O75054 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
IGSF3O75054 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
IGSF3O75054 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
IGSF3O75054 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
IGSF3O75054 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
IGSF3O75054 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
IGSF3O75054 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
IGSF3O75054 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
IGSF3O75054 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
IGSF3O75054 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
IGSF3O75054 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
IGSF3O75054 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
IGSF3O75054 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
IGSF3O75054 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
IGSF3O75054 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
IGSF3O75054 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
IGSF3O75054 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
IGSF3O75054 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
IGSF3O75054 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
IGSF3O75054 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
IGSF3O75054 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
IGSF3O75054 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
IGSF3O75054 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
IGSF3O75054 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
IGSF3O75054 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms