Protein–RNA interactions for Protein: O60682

MSC, Musculin, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSCO60682 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
MSCO60682 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
MSCO60682 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
MSCO60682 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
MSCO60682 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
MSCO60682 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
MSCO60682 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
MSCO60682 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
MSCO60682 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
MSCO60682 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
MSCO60682 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
MSCO60682 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
MSCO60682 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
MSCO60682 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
MSCO60682 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
MSCO60682 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
MSCO60682 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
MSCO60682 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
MSCO60682 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
MSCO60682 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
MSCO60682 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
MSCO60682 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
MSCO60682 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
MSCO60682 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
MSCO60682 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
MSCO60682 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
MSCO60682 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
MSCO60682 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
MSCO60682 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
MSCO60682 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
MSCO60682 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
MSCO60682 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
MSCO60682 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
MSCO60682 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
MSCO60682 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
MSCO60682 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
MSCO60682 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
MSCO60682 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
MSCO60682 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
MSCO60682 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
MSCO60682 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
MSCO60682 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
MSCO60682 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
MSCO60682 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
MSCO60682 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
MSCO60682 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
MSCO60682 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
MSCO60682 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
MSCO60682 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
MSCO60682 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
MSCO60682 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
MSCO60682 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
MSCO60682 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
MSCO60682 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
MSCO60682 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
MSCO60682 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
MSCO60682 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
MSCO60682 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
MSCO60682 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
MSCO60682 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
MSCO60682 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
MSCO60682 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
MSCO60682 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
MSCO60682 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
MSCO60682 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
MSCO60682 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
MSCO60682 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
MSCO60682 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
MSCO60682 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
MSCO60682 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
MSCO60682 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
MSCO60682 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
MSCO60682 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
MSCO60682 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
MSCO60682 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
MSCO60682 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
MSCO60682 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
MSCO60682 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
MSCO60682 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
MSCO60682 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
MSCO60682 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
MSCO60682 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
MSCO60682 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
MSCO60682 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
MSCO60682 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
MSCO60682 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
MSCO60682 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
MSCO60682 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
MSCO60682 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
MSCO60682 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
MSCO60682 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
MSCO60682 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
MSCO60682 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
MSCO60682 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
MSCO60682 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
MSCO60682 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
MSCO60682 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
MSCO60682 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
MSCO60682 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
MSCO60682 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms