Protein–RNA interactions for Protein: O43791

SPOP, Speckle-type POZ protein, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOPO43791 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SPOPO43791 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SPOPO43791 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SPOPO43791 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SPOPO43791 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SPOPO43791 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SPOPO43791 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SPOPO43791 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SPOPO43791 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SPOPO43791 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SPOPO43791 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SPOPO43791 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SPOPO43791 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SPOPO43791 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SPOPO43791 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SPOPO43791 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SPOPO43791 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SPOPO43791 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SPOPO43791 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SPOPO43791 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SPOPO43791 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SPOPO43791 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SPOPO43791 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
SPOPO43791 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SPOPO43791 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SPOPO43791 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SPOPO43791 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SPOPO43791 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SPOPO43791 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SPOPO43791 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
SPOPO43791 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SPOPO43791 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SPOPO43791 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SPOPO43791 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SPOPO43791 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SPOPO43791 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SPOPO43791 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SPOPO43791 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SPOPO43791 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SPOPO43791 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SPOPO43791 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SPOPO43791 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SPOPO43791 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SPOPO43791 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SPOPO43791 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SPOPO43791 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SPOPO43791 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SPOPO43791 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SPOPO43791 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SPOPO43791 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SPOPO43791 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SPOPO43791 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SPOPO43791 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SPOPO43791 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SPOPO43791 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SPOPO43791 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SPOPO43791 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SPOPO43791 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SPOPO43791 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SPOPO43791 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SPOPO43791 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SPOPO43791 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SPOPO43791 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SPOPO43791 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SPOPO43791 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SPOPO43791 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SPOPO43791 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SPOPO43791 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SPOPO43791 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SPOPO43791 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SPOPO43791 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SPOPO43791 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SPOPO43791 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SPOPO43791 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
SPOPO43791 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
SPOPO43791 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
SPOPO43791 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SPOPO43791 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SPOPO43791 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SPOPO43791 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SPOPO43791 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SPOPO43791 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SPOPO43791 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SPOPO43791 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SPOPO43791 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SPOPO43791 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SPOPO43791 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SPOPO43791 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SPOPO43791 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SPOPO43791 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SPOPO43791 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SPOPO43791 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SPOPO43791 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SPOPO43791 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SPOPO43791 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SPOPO43791 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SPOPO43791 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SPOPO43791 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SPOPO43791 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SPOPO43791 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms