Protein–RNA interactions for Protein: O43679

LDB2, LIM domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDB2O43679 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LDB2O43679 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
LDB2O43679 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LDB2O43679 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LDB2O43679 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LDB2O43679 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LDB2O43679 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LDB2O43679 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LDB2O43679 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LDB2O43679 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LDB2O43679 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LDB2O43679 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LDB2O43679 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LDB2O43679 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LDB2O43679 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LDB2O43679 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LDB2O43679 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LDB2O43679 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LDB2O43679 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LDB2O43679 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LDB2O43679 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LDB2O43679 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LDB2O43679 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LDB2O43679 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LDB2O43679 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LDB2O43679 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LDB2O43679 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LDB2O43679 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
LDB2O43679 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LDB2O43679 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
LDB2O43679 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
LDB2O43679 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LDB2O43679 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LDB2O43679 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LDB2O43679 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LDB2O43679 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LDB2O43679 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LDB2O43679 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LDB2O43679 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LDB2O43679 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LDB2O43679 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LDB2O43679 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LDB2O43679 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LDB2O43679 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
LDB2O43679 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LDB2O43679 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LDB2O43679 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LDB2O43679 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LDB2O43679 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LDB2O43679 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LDB2O43679 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LDB2O43679 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LDB2O43679 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LDB2O43679 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LDB2O43679 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LDB2O43679 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LDB2O43679 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LDB2O43679 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LDB2O43679 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LDB2O43679 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LDB2O43679 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LDB2O43679 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LDB2O43679 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LDB2O43679 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LDB2O43679 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LDB2O43679 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LDB2O43679 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LDB2O43679 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LDB2O43679 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
LDB2O43679 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LDB2O43679 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LDB2O43679 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LDB2O43679 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LDB2O43679 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LDB2O43679 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LDB2O43679 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
LDB2O43679 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LDB2O43679 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LDB2O43679 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LDB2O43679 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LDB2O43679 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
LDB2O43679 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LDB2O43679 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LDB2O43679 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LDB2O43679 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LDB2O43679 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LDB2O43679 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LDB2O43679 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LDB2O43679 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LDB2O43679 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LDB2O43679 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LDB2O43679 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LDB2O43679 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LDB2O43679 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LDB2O43679 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
LDB2O43679 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
LDB2O43679 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LDB2O43679 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LDB2O43679 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LDB2O43679 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms