Protein–RNA interactions for Protein: O43678

NDUFA2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA2O43678 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDUFA2O43678 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDUFA2O43678 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDUFA2O43678 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDUFA2O43678 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDUFA2O43678 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDUFA2O43678 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDUFA2O43678 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDUFA2O43678 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDUFA2O43678 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDUFA2O43678 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDUFA2O43678 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDUFA2O43678 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDUFA2O43678 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDUFA2O43678 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDUFA2O43678 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDUFA2O43678 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDUFA2O43678 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDUFA2O43678 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDUFA2O43678 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDUFA2O43678 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDUFA2O43678 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDUFA2O43678 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDUFA2O43678 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NDUFA2O43678 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDUFA2O43678 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDUFA2O43678 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NDUFA2O43678 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NDUFA2O43678 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDUFA2O43678 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDUFA2O43678 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDUFA2O43678 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDUFA2O43678 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDUFA2O43678 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDUFA2O43678 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDUFA2O43678 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDUFA2O43678 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDUFA2O43678 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDUFA2O43678 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDUFA2O43678 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDUFA2O43678 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDUFA2O43678 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDUFA2O43678 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDUFA2O43678 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDUFA2O43678 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDUFA2O43678 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDUFA2O43678 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDUFA2O43678 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDUFA2O43678 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDUFA2O43678 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDUFA2O43678 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDUFA2O43678 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NDUFA2O43678 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NDUFA2O43678 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NDUFA2O43678 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NDUFA2O43678 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NDUFA2O43678 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NDUFA2O43678 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NDUFA2O43678 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NDUFA2O43678 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDUFA2O43678 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDUFA2O43678 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NDUFA2O43678 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDUFA2O43678 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDUFA2O43678 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDUFA2O43678 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NDUFA2O43678 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDUFA2O43678 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDUFA2O43678 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDUFA2O43678 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDUFA2O43678 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDUFA2O43678 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDUFA2O43678 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDUFA2O43678 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDUFA2O43678 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NDUFA2O43678 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDUFA2O43678 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDUFA2O43678 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDUFA2O43678 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NDUFA2O43678 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NDUFA2O43678 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NDUFA2O43678 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDUFA2O43678 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDUFA2O43678 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDUFA2O43678 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDUFA2O43678 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDUFA2O43678 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDUFA2O43678 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDUFA2O43678 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDUFA2O43678 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NDUFA2O43678 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDUFA2O43678 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDUFA2O43678 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDUFA2O43678 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDUFA2O43678 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDUFA2O43678 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDUFA2O43678 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDUFA2O43678 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDUFA2O43678 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDUFA2O43678 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms