Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
CEP290O15078 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
CEP290O15078 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CEP290O15078 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CEP290O15078 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CEP290O15078 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CEP290O15078 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CEP290O15078 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CEP290O15078 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CEP290O15078 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CEP290O15078 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CEP290O15078 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CEP290O15078 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CEP290O15078 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CEP290O15078 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CEP290O15078 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CEP290O15078 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CEP290O15078 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CEP290O15078 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CEP290O15078 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
CEP290O15078 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CEP290O15078 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CEP290O15078 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CEP290O15078 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
CEP290O15078 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CEP290O15078 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CEP290O15078 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CEP290O15078 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CEP290O15078 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CEP290O15078 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CEP290O15078 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CEP290O15078 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CEP290O15078 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CEP290O15078 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CEP290O15078 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CEP290O15078 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CEP290O15078 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CEP290O15078 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CEP290O15078 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CEP290O15078 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CEP290O15078 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
CEP290O15078 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
CEP290O15078 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CEP290O15078 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CEP290O15078 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CEP290O15078 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CEP290O15078 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CEP290O15078 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
CEP290O15078 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CEP290O15078 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CEP290O15078 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CEP290O15078 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CEP290O15078 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CEP290O15078 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CEP290O15078 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CEP290O15078 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CEP290O15078 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CEP290O15078 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CEP290O15078 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CEP290O15078 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CEP290O15078 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CEP290O15078 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CEP290O15078 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CEP290O15078 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
CEP290O15078 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CEP290O15078 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CEP290O15078 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CEP290O15078 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CEP290O15078 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CEP290O15078 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CEP290O15078 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CEP290O15078 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CEP290O15078 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CEP290O15078 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CEP290O15078 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
CEP290O15078 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CEP290O15078 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CEP290O15078 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CEP290O15078 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CEP290O15078 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CEP290O15078 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CEP290O15078 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CEP290O15078 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CEP290O15078 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CEP290O15078 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CEP290O15078 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CEP290O15078 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CEP290O15078 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
CEP290O15078 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CEP290O15078 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CEP290O15078 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CEP290O15078 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CEP290O15078 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CEP290O15078 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CEP290O15078 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CEP290O15078 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CEP290O15078 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CEP290O15078 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CEP290O15078 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CEP290O15078 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms