Protein–RNA interactions for Protein: O00629

KPNA4, Importin subunit alpha-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA4O00629 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KPNA4O00629 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KPNA4O00629 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KPNA4O00629 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KPNA4O00629 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
KPNA4O00629 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KPNA4O00629 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KPNA4O00629 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KPNA4O00629 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KPNA4O00629 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KPNA4O00629 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KPNA4O00629 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KPNA4O00629 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
KPNA4O00629 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KPNA4O00629 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KPNA4O00629 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KPNA4O00629 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KPNA4O00629 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KPNA4O00629 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KPNA4O00629 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KPNA4O00629 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KPNA4O00629 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KPNA4O00629 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KPNA4O00629 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KPNA4O00629 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KPNA4O00629 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KPNA4O00629 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KPNA4O00629 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KPNA4O00629 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
KPNA4O00629 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KPNA4O00629 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KPNA4O00629 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KPNA4O00629 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KPNA4O00629 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KPNA4O00629 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KPNA4O00629 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KPNA4O00629 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KPNA4O00629 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KPNA4O00629 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KPNA4O00629 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KPNA4O00629 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KPNA4O00629 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KPNA4O00629 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KPNA4O00629 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KPNA4O00629 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KPNA4O00629 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KPNA4O00629 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KPNA4O00629 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KPNA4O00629 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KPNA4O00629 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KPNA4O00629 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KPNA4O00629 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KPNA4O00629 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KPNA4O00629 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KPNA4O00629 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KPNA4O00629 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KPNA4O00629 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KPNA4O00629 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KPNA4O00629 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KPNA4O00629 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KPNA4O00629 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KPNA4O00629 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KPNA4O00629 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
KPNA4O00629 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KPNA4O00629 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KPNA4O00629 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KPNA4O00629 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KPNA4O00629 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KPNA4O00629 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KPNA4O00629 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KPNA4O00629 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KPNA4O00629 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KPNA4O00629 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KPNA4O00629 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KPNA4O00629 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KPNA4O00629 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KPNA4O00629 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KPNA4O00629 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KPNA4O00629 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KPNA4O00629 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KPNA4O00629 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KPNA4O00629 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KPNA4O00629 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KPNA4O00629 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KPNA4O00629 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KPNA4O00629 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KPNA4O00629 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KPNA4O00629 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KPNA4O00629 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KPNA4O00629 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KPNA4O00629 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KPNA4O00629 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KPNA4O00629 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KPNA4O00629 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KPNA4O00629 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KPNA4O00629 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KPNA4O00629 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KPNA4O00629 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KPNA4O00629 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KPNA4O00629 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms