Protein–RNA interactions for Protein: O00522

KRIT1, Krev interaction trapped protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRIT1O00522 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KRIT1O00522 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
KRIT1O00522 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
KRIT1O00522 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KRIT1O00522 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KRIT1O00522 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KRIT1O00522 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KRIT1O00522 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KRIT1O00522 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KRIT1O00522 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KRIT1O00522 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KRIT1O00522 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KRIT1O00522 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KRIT1O00522 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KRIT1O00522 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KRIT1O00522 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KRIT1O00522 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KRIT1O00522 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KRIT1O00522 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KRIT1O00522 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KRIT1O00522 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KRIT1O00522 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KRIT1O00522 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
KRIT1O00522 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KRIT1O00522 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KRIT1O00522 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KRIT1O00522 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KRIT1O00522 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KRIT1O00522 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KRIT1O00522 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KRIT1O00522 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
KRIT1O00522 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KRIT1O00522 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KRIT1O00522 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KRIT1O00522 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KRIT1O00522 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRIT1O00522 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRIT1O00522 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRIT1O00522 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRIT1O00522 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KRIT1O00522 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KRIT1O00522 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KRIT1O00522 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KRIT1O00522 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KRIT1O00522 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
KRIT1O00522 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KRIT1O00522 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.56■■■□□ 2
KRIT1O00522 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
KRIT1O00522 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KRIT1O00522 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KRIT1O00522 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
KRIT1O00522 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
KRIT1O00522 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
KRIT1O00522 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KRIT1O00522 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KRIT1O00522 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
KRIT1O00522 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.51■■■□□ 2
KRIT1O00522 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
KRIT1O00522 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KRIT1O00522 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KRIT1O00522 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KRIT1O00522 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KRIT1O00522 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KRIT1O00522 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KRIT1O00522 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KRIT1O00522 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KRIT1O00522 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KRIT1O00522 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KRIT1O00522 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KRIT1O00522 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KRIT1O00522 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KRIT1O00522 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KRIT1O00522 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KRIT1O00522 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KRIT1O00522 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KRIT1O00522 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KRIT1O00522 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
KRIT1O00522 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
KRIT1O00522 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KRIT1O00522 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
KRIT1O00522 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KRIT1O00522 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KRIT1O00522 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KRIT1O00522 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KRIT1O00522 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KRIT1O00522 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KRIT1O00522 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KRIT1O00522 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KRIT1O00522 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KRIT1O00522 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KRIT1O00522 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
KRIT1O00522 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KRIT1O00522 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KRIT1O00522 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
KRIT1O00522 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KRIT1O00522 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KRIT1O00522 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KRIT1O00522 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KRIT1O00522 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KRIT1O00522 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.7 ms