Protein–RNA interactions for Protein: O00515

LAD1, Ladinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAD1O00515 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
LAD1O00515 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
LAD1O00515 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
LAD1O00515 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
LAD1O00515 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
LAD1O00515 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
LAD1O00515 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
LAD1O00515 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
LAD1O00515 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
LAD1O00515 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
LAD1O00515 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
LAD1O00515 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
LAD1O00515 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
LAD1O00515 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
LAD1O00515 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
LAD1O00515 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
LAD1O00515 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
LAD1O00515 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
LAD1O00515 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
LAD1O00515 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
LAD1O00515 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
LAD1O00515 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
LAD1O00515 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
LAD1O00515 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
LAD1O00515 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
LAD1O00515 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
LAD1O00515 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
LAD1O00515 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
LAD1O00515 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
LAD1O00515 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
LAD1O00515 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
LAD1O00515 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
LAD1O00515 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
LAD1O00515 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
LAD1O00515 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
LAD1O00515 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
LAD1O00515 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
LAD1O00515 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
LAD1O00515 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
LAD1O00515 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
LAD1O00515 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
LAD1O00515 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
LAD1O00515 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
LAD1O00515 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
LAD1O00515 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
LAD1O00515 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
LAD1O00515 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
LAD1O00515 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
LAD1O00515 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
LAD1O00515 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
LAD1O00515 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.64■■■□□ 2.34
LAD1O00515 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
LAD1O00515 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
LAD1O00515 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
LAD1O00515 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
LAD1O00515 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
LAD1O00515 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
LAD1O00515 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
LAD1O00515 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
LAD1O00515 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
LAD1O00515 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LAD1O00515 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LAD1O00515 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
LAD1O00515 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
LAD1O00515 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
LAD1O00515 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
LAD1O00515 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
LAD1O00515 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
LAD1O00515 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
LAD1O00515 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
LAD1O00515 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
LAD1O00515 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
LAD1O00515 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
LAD1O00515 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
LAD1O00515 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LAD1O00515 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
LAD1O00515 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
LAD1O00515 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LAD1O00515 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
LAD1O00515 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LAD1O00515 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LAD1O00515 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
LAD1O00515 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
LAD1O00515 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
LAD1O00515 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
LAD1O00515 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
LAD1O00515 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
LAD1O00515 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
LAD1O00515 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
LAD1O00515 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
LAD1O00515 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
LAD1O00515 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
LAD1O00515 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
LAD1O00515 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
LAD1O00515 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
LAD1O00515 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
LAD1O00515 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LAD1O00515 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LAD1O00515 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LAD1O00515 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms