Protein–RNA interactions for Protein: F8WFD2

NPIPA3, Nuclear pore complex-interacting protein family member A3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA3F8WFD2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NPIPA3F8WFD2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NPIPA3F8WFD2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NPIPA3F8WFD2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NPIPA3F8WFD2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NPIPA3F8WFD2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NPIPA3F8WFD2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NPIPA3F8WFD2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NPIPA3F8WFD2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NPIPA3F8WFD2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NPIPA3F8WFD2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NPIPA3F8WFD2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NPIPA3F8WFD2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NPIPA3F8WFD2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NPIPA3F8WFD2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NPIPA3F8WFD2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NPIPA3F8WFD2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NPIPA3F8WFD2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NPIPA3F8WFD2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NPIPA3F8WFD2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NPIPA3F8WFD2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NPIPA3F8WFD2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NPIPA3F8WFD2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NPIPA3F8WFD2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NPIPA3F8WFD2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NPIPA3F8WFD2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NPIPA3F8WFD2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NPIPA3F8WFD2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NPIPA3F8WFD2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NPIPA3F8WFD2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NPIPA3F8WFD2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NPIPA3F8WFD2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NPIPA3F8WFD2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NPIPA3F8WFD2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NPIPA3F8WFD2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NPIPA3F8WFD2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NPIPA3F8WFD2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NPIPA3F8WFD2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NPIPA3F8WFD2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NPIPA3F8WFD2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NPIPA3F8WFD2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NPIPA3F8WFD2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NPIPA3F8WFD2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NPIPA3F8WFD2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NPIPA3F8WFD2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
NPIPA3F8WFD2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NPIPA3F8WFD2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NPIPA3F8WFD2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NPIPA3F8WFD2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NPIPA3F8WFD2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NPIPA3F8WFD2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NPIPA3F8WFD2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NPIPA3F8WFD2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NPIPA3F8WFD2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NPIPA3F8WFD2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NPIPA3F8WFD2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NPIPA3F8WFD2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NPIPA3F8WFD2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NPIPA3F8WFD2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NPIPA3F8WFD2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NPIPA3F8WFD2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NPIPA3F8WFD2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NPIPA3F8WFD2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NPIPA3F8WFD2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NPIPA3F8WFD2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NPIPA3F8WFD2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NPIPA3F8WFD2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NPIPA3F8WFD2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NPIPA3F8WFD2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NPIPA3F8WFD2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NPIPA3F8WFD2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NPIPA3F8WFD2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NPIPA3F8WFD2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NPIPA3F8WFD2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NPIPA3F8WFD2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NPIPA3F8WFD2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NPIPA3F8WFD2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NPIPA3F8WFD2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NPIPA3F8WFD2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NPIPA3F8WFD2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NPIPA3F8WFD2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NPIPA3F8WFD2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NPIPA3F8WFD2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NPIPA3F8WFD2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NPIPA3F8WFD2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NPIPA3F8WFD2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NPIPA3F8WFD2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NPIPA3F8WFD2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NPIPA3F8WFD2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NPIPA3F8WFD2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NPIPA3F8WFD2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NPIPA3F8WFD2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NPIPA3F8WFD2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NPIPA3F8WFD2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NPIPA3F8WFD2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NPIPA3F8WFD2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NPIPA3F8WFD2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NPIPA3F8WFD2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NPIPA3F8WFD2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NPIPA3F8WFD2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms