Protein–RNA interactions for Protein: E9PIF3

NPIPA2, Nuclear pore complex-interacting protein family member A2, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA2E9PIF3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NPIPA2E9PIF3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NPIPA2E9PIF3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NPIPA2E9PIF3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NPIPA2E9PIF3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NPIPA2E9PIF3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NPIPA2E9PIF3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NPIPA2E9PIF3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NPIPA2E9PIF3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NPIPA2E9PIF3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NPIPA2E9PIF3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NPIPA2E9PIF3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NPIPA2E9PIF3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NPIPA2E9PIF3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NPIPA2E9PIF3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NPIPA2E9PIF3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NPIPA2E9PIF3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NPIPA2E9PIF3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NPIPA2E9PIF3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NPIPA2E9PIF3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NPIPA2E9PIF3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NPIPA2E9PIF3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NPIPA2E9PIF3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NPIPA2E9PIF3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NPIPA2E9PIF3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NPIPA2E9PIF3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NPIPA2E9PIF3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NPIPA2E9PIF3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NPIPA2E9PIF3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NPIPA2E9PIF3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NPIPA2E9PIF3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NPIPA2E9PIF3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NPIPA2E9PIF3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NPIPA2E9PIF3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NPIPA2E9PIF3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NPIPA2E9PIF3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NPIPA2E9PIF3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NPIPA2E9PIF3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NPIPA2E9PIF3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NPIPA2E9PIF3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NPIPA2E9PIF3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NPIPA2E9PIF3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NPIPA2E9PIF3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NPIPA2E9PIF3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NPIPA2E9PIF3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
NPIPA2E9PIF3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NPIPA2E9PIF3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NPIPA2E9PIF3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NPIPA2E9PIF3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NPIPA2E9PIF3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NPIPA2E9PIF3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NPIPA2E9PIF3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NPIPA2E9PIF3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NPIPA2E9PIF3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NPIPA2E9PIF3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NPIPA2E9PIF3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NPIPA2E9PIF3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NPIPA2E9PIF3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NPIPA2E9PIF3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NPIPA2E9PIF3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NPIPA2E9PIF3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NPIPA2E9PIF3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NPIPA2E9PIF3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NPIPA2E9PIF3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NPIPA2E9PIF3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NPIPA2E9PIF3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NPIPA2E9PIF3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NPIPA2E9PIF3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NPIPA2E9PIF3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NPIPA2E9PIF3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NPIPA2E9PIF3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NPIPA2E9PIF3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NPIPA2E9PIF3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NPIPA2E9PIF3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NPIPA2E9PIF3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NPIPA2E9PIF3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NPIPA2E9PIF3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NPIPA2E9PIF3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NPIPA2E9PIF3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NPIPA2E9PIF3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NPIPA2E9PIF3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NPIPA2E9PIF3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NPIPA2E9PIF3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NPIPA2E9PIF3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NPIPA2E9PIF3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NPIPA2E9PIF3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NPIPA2E9PIF3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NPIPA2E9PIF3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NPIPA2E9PIF3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NPIPA2E9PIF3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NPIPA2E9PIF3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NPIPA2E9PIF3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NPIPA2E9PIF3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NPIPA2E9PIF3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NPIPA2E9PIF3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NPIPA2E9PIF3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NPIPA2E9PIF3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NPIPA2E9PIF3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NPIPA2E9PIF3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NPIPA2E9PIF3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms