Protein–RNA interactions for Protein: A6NI03

TRIM64B, Putative tripartite motif-containing protein 64B, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM64BA6NI03 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM64BA6NI03 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM64BA6NI03 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM64BA6NI03 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM64BA6NI03 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM64BA6NI03 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM64BA6NI03 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM64BA6NI03 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM64BA6NI03 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM64BA6NI03 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM64BA6NI03 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM64BA6NI03 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM64BA6NI03 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM64BA6NI03 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM64BA6NI03 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM64BA6NI03 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM64BA6NI03 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM64BA6NI03 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM64BA6NI03 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM64BA6NI03 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM64BA6NI03 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM64BA6NI03 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM64BA6NI03 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM64BA6NI03 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM64BA6NI03 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM64BA6NI03 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM64BA6NI03 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM64BA6NI03 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM64BA6NI03 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM64BA6NI03 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRIM64BA6NI03 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM64BA6NI03 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM64BA6NI03 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM64BA6NI03 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM64BA6NI03 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM64BA6NI03 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM64BA6NI03 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM64BA6NI03 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM64BA6NI03 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM64BA6NI03 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM64BA6NI03 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM64BA6NI03 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM64BA6NI03 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM64BA6NI03 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM64BA6NI03 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM64BA6NI03 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM64BA6NI03 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM64BA6NI03 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM64BA6NI03 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRIM64BA6NI03 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM64BA6NI03 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM64BA6NI03 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM64BA6NI03 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM64BA6NI03 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM64BA6NI03 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM64BA6NI03 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM64BA6NI03 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM64BA6NI03 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM64BA6NI03 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM64BA6NI03 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM64BA6NI03 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM64BA6NI03 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM64BA6NI03 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM64BA6NI03 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM64BA6NI03 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM64BA6NI03 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM64BA6NI03 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM64BA6NI03 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM64BA6NI03 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM64BA6NI03 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM64BA6NI03 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM64BA6NI03 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM64BA6NI03 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM64BA6NI03 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM64BA6NI03 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM64BA6NI03 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM64BA6NI03 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM64BA6NI03 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM64BA6NI03 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM64BA6NI03 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM64BA6NI03 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM64BA6NI03 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM64BA6NI03 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM64BA6NI03 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM64BA6NI03 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM64BA6NI03 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM64BA6NI03 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM64BA6NI03 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM64BA6NI03 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM64BA6NI03 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM64BA6NI03 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM64BA6NI03 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM64BA6NI03 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM64BA6NI03 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM64BA6NI03 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM64BA6NI03 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM64BA6NI03 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM64BA6NI03 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM64BA6NI03 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM64BA6NI03 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms