Protein–RNA interactions for Protein: A6H8Y1

BDP1, Transcription factor TFIIIB component B'' homolog, humanhuman

Predictions only

Length 2,624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BDP1A6H8Y1 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BDP1A6H8Y1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
BDP1A6H8Y1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
BDP1A6H8Y1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
BDP1A6H8Y1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
BDP1A6H8Y1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BDP1A6H8Y1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BDP1A6H8Y1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
BDP1A6H8Y1 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
BDP1A6H8Y1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
BDP1A6H8Y1 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
BDP1A6H8Y1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
BDP1A6H8Y1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
BDP1A6H8Y1 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
BDP1A6H8Y1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
BDP1A6H8Y1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
BDP1A6H8Y1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
BDP1A6H8Y1 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
BDP1A6H8Y1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
BDP1A6H8Y1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
BDP1A6H8Y1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
BDP1A6H8Y1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
BDP1A6H8Y1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
BDP1A6H8Y1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
BDP1A6H8Y1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
BDP1A6H8Y1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
BDP1A6H8Y1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
BDP1A6H8Y1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
BDP1A6H8Y1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
BDP1A6H8Y1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
BDP1A6H8Y1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
BDP1A6H8Y1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
BDP1A6H8Y1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
BDP1A6H8Y1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BDP1A6H8Y1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BDP1A6H8Y1 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BDP1A6H8Y1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BDP1A6H8Y1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
BDP1A6H8Y1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
BDP1A6H8Y1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
BDP1A6H8Y1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
BDP1A6H8Y1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
BDP1A6H8Y1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BDP1A6H8Y1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BDP1A6H8Y1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BDP1A6H8Y1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
BDP1A6H8Y1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BDP1A6H8Y1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BDP1A6H8Y1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BDP1A6H8Y1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BDP1A6H8Y1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BDP1A6H8Y1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BDP1A6H8Y1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
BDP1A6H8Y1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
BDP1A6H8Y1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
BDP1A6H8Y1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BDP1A6H8Y1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BDP1A6H8Y1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BDP1A6H8Y1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BDP1A6H8Y1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BDP1A6H8Y1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
BDP1A6H8Y1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
BDP1A6H8Y1 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BDP1A6H8Y1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BDP1A6H8Y1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.54■■■□□ 2
BDP1A6H8Y1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
BDP1A6H8Y1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BDP1A6H8Y1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.52■■■□□ 2
BDP1A6H8Y1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
BDP1A6H8Y1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
BDP1A6H8Y1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
BDP1A6H8Y1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BDP1A6H8Y1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BDP1A6H8Y1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BDP1A6H8Y1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
BDP1A6H8Y1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
BDP1A6H8Y1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
BDP1A6H8Y1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
BDP1A6H8Y1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
BDP1A6H8Y1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
BDP1A6H8Y1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
BDP1A6H8Y1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
BDP1A6H8Y1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
BDP1A6H8Y1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
BDP1A6H8Y1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
BDP1A6H8Y1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
BDP1A6H8Y1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
BDP1A6H8Y1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
BDP1A6H8Y1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
BDP1A6H8Y1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
BDP1A6H8Y1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
BDP1A6H8Y1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
BDP1A6H8Y1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BDP1A6H8Y1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BDP1A6H8Y1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BDP1A6H8Y1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
BDP1A6H8Y1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
BDP1A6H8Y1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
BDP1A6H8Y1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
BDP1A6H8Y1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms