Protein–RNA interactions for Protein: A4IF30

SLC35F4, Solute carrier family 35 member F4, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35F4A4IF30 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC35F4A4IF30 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC35F4A4IF30 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC35F4A4IF30 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC35F4A4IF30 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC35F4A4IF30 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC35F4A4IF30 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC35F4A4IF30 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC35F4A4IF30 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC35F4A4IF30 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC35F4A4IF30 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC35F4A4IF30 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC35F4A4IF30 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC35F4A4IF30 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC35F4A4IF30 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC35F4A4IF30 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC35F4A4IF30 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC35F4A4IF30 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC35F4A4IF30 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC35F4A4IF30 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC35F4A4IF30 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC35F4A4IF30 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC35F4A4IF30 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC35F4A4IF30 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC35F4A4IF30 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC35F4A4IF30 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC35F4A4IF30 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC35F4A4IF30 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC35F4A4IF30 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC35F4A4IF30 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC35F4A4IF30 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC35F4A4IF30 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC35F4A4IF30 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC35F4A4IF30 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC35F4A4IF30 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC35F4A4IF30 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC35F4A4IF30 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC35F4A4IF30 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC35F4A4IF30 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SLC35F4A4IF30 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SLC35F4A4IF30 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SLC35F4A4IF30 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC35F4A4IF30 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC35F4A4IF30 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC35F4A4IF30 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC35F4A4IF30 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC35F4A4IF30 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC35F4A4IF30 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC35F4A4IF30 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC35F4A4IF30 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC35F4A4IF30 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC35F4A4IF30 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC35F4A4IF30 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC35F4A4IF30 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC35F4A4IF30 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC35F4A4IF30 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC35F4A4IF30 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC35F4A4IF30 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC35F4A4IF30 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC35F4A4IF30 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC35F4A4IF30 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC35F4A4IF30 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC35F4A4IF30 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC35F4A4IF30 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC35F4A4IF30 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC35F4A4IF30 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC35F4A4IF30 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC35F4A4IF30 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC35F4A4IF30 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC35F4A4IF30 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC35F4A4IF30 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC35F4A4IF30 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC35F4A4IF30 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC35F4A4IF30 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC35F4A4IF30 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC35F4A4IF30 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC35F4A4IF30 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC35F4A4IF30 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC35F4A4IF30 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC35F4A4IF30 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC35F4A4IF30 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC35F4A4IF30 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC35F4A4IF30 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC35F4A4IF30 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC35F4A4IF30 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC35F4A4IF30 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC35F4A4IF30 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC35F4A4IF30 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC35F4A4IF30 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC35F4A4IF30 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC35F4A4IF30 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC35F4A4IF30 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC35F4A4IF30 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC35F4A4IF30 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC35F4A4IF30 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC35F4A4IF30 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC35F4A4IF30 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC35F4A4IF30 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC35F4A4IF30 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC35F4A4IF30 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms