Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQK1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQK1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
A0A0U1RQK1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
A0A0U1RQK1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
A0A0U1RQK1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
A0A0U1RQK1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
A0A0U1RQK1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
A0A0U1RQK1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
A0A0U1RQK1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
A0A0U1RQK1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
A0A0U1RQK1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
A0A0U1RQK1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
A0A0U1RQK1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
A0A0U1RQK1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
A0A0U1RQK1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
A0A0U1RQK1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
A0A0U1RQK1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
A0A0U1RQK1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
A0A0U1RQK1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
A0A0U1RQK1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
A0A0U1RQK1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
A0A0U1RQK1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
A0A0U1RQK1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
A0A0U1RQK1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
A0A0U1RQK1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
A0A0U1RQK1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
A0A0U1RQK1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
A0A0U1RQK1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
A0A0U1RQK1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
A0A0U1RQK1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
A0A0U1RQK1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
A0A0U1RQK1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
A0A0U1RQK1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
A0A0U1RQK1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
A0A0U1RQK1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
A0A0U1RQK1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
A0A0U1RQK1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
A0A0U1RQK1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
A0A0U1RQK1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
A0A0U1RQK1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
A0A0U1RQK1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
A0A0U1RQK1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
A0A0U1RQK1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
A0A0U1RQK1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
A0A0U1RQK1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
A0A0U1RQK1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
A0A0U1RQK1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
A0A0U1RQK1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
A0A0U1RQK1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
A0A0U1RQK1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
A0A0U1RQK1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
A0A0U1RQK1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
A0A0U1RQK1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
A0A0U1RQK1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
A0A0U1RQK1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
A0A0U1RQK1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
A0A0U1RQK1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
A0A0U1RQK1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
A0A0U1RQK1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
A0A0U1RQK1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
A0A0U1RQK1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
A0A0U1RQK1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
A0A0U1RQK1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
A0A0U1RQK1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
A0A0U1RQK1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
A0A0U1RQK1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
A0A0U1RQK1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
A0A0U1RQK1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
A0A0U1RQK1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
A0A0U1RQK1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
A0A0U1RQK1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
A0A0U1RQK1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
A0A0U1RQK1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
A0A0U1RQK1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
A0A0U1RQK1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
A0A0U1RQK1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
A0A0U1RQK1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
A0A0U1RQK1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
A0A0U1RQK1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
A0A0U1RQK1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
A0A0U1RQK1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
A0A0U1RQK1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
A0A0U1RQK1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
A0A0U1RQK1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
A0A0U1RQK1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
A0A0U1RQK1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
A0A0U1RQK1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
A0A0U1RQK1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
A0A0U1RQK1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
A0A0U1RQK1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
A0A0U1RQK1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
A0A0U1RQK1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
A0A0U1RQK1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
A0A0U1RQK1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A0U1RQK1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A0U1RQK1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A0U1RQK1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A0U1RQK1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A0U1RQK1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A0U1RQK1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A0U1RQK1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms