Protein–RNA interactions for Protein: P43088

PTGFR, Prostaglandin F2-alpha receptor, humanhuman

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGFRP43088 LINC01719-204ENST00000611275 2054 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 NFRKB-202ENST00000524746 4114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 LINC01519-201ENST00000454178 2029 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 CYP2C8-211ENST00000539050 2024 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 AP005230.1-205ENST00000639316 2015 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 MAPK10-298ENST00000641297 3040 ntAPPRIS P2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 NTRK3-201ENST00000317501 3826 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 AC011632.1-202ENST00000518128 2810 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 AC005538.2-201ENST00000623215 1864 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 KIAA0319-206ENST00000616673 5315 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 GON4L-203ENST00000368331 7823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 NVL-202ENST00000340871 2431 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 CEACAM8-201ENST00000244336 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 DIEXF-202ENST00000491415 8446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 MYO10-201ENST00000274203 11456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 PPP1R11-203ENST00000376765 1536 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 AC006141.1-201ENST00000581917 2170 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 FANCB-201ENST00000324138 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 SUB1-201ENST00000265073 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 LTBP1-201ENST00000402934 4948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 NCAPH-201ENST00000240423 2763 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 PTPN20-205ENST00000395721 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 RPL23AP7-202ENST00000416673 2078 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 AL160408.1-201ENST00000417805 1373 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 FAM122B-206ENST00000486347 1381 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 ATG13-203ENST00000524625 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 OR4K1-202ENST00000641172 1339 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 NF1P1-201ENST00000604105 2645 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 NFIA-206ENST00000371191 1916 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 NECAP1P1-201ENST00000320802 830 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 RN7SKP10-201ENST00000364291 325 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 RNA5SP69-201ENST00000364477 117 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 U3.18-201ENST00000390880 216 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 CEBPZOS-201ENST00000392061 695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 MIR1208-201ENST00000408334 73 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 AF130417.1-201ENST00000432412 478 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 AL513122.2-201ENST00000437135 838 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 RPSAP76-201ENST00000444599 853 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 LINC01937-201ENST00000448543 553 ntTSL 4 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 VDAC1P12-201ENST00000451853 882 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 ITPKB-AS1-201ENST00000453525 538 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 AP001464.1-201ENST00000457565 323 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 RN7SL566P-201ENST00000467650 296 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 AC018638.2-201ENST00000471258 403 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 AC080013.1-205ENST00000477589 1087 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 RPL22-207ENST00000484532 449 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 AL590867.2-201ENST00000492974 447 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 AC121161.2-201ENST00000502566 659 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 BTNL8-207ENST00000511704 1260 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 DCAF13-203ENST00000519682 837 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 TBCA-208ENST00000520361 446 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 GLYATL1P3-201ENST00000527482 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 AP001973.1-201ENST00000530177 572 ntTSL 4 BASIC7.63□□□□□ -1.19
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PTGFRP43088 AC106788.1-202ENST00000548889 1212 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 AL591767.2-201ENST00000554984 173 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 AC060814.2-201ENST00000556905 1089 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 AC009075.1-201ENST00000563347 391 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
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PTGFRP43088 AC011477.1-201ENST00000591884 544 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
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PTGFRP43088 HAR1B-202ENST00000608031 773 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
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PTGFRP43088 AL590491.1-202ENST00000618038 394 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 LINC02028-221ENST00000622169 621 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
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PTGFRP43088 ZNF100-202ENST00000358296 5745 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
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PTGFRP43088 SH2D4A-202ENST00000518040 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 USP17L21-202ENST00000621388 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 JAKMIP2-201ENST00000265272 6001 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 IGFN1-202ENST00000335211 11810 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 FCGR3B-202ENST00000367964 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 SERBP1-203ENST00000370994 6676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 LINC00598-214ENST00000637523 1943 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 TARS-201ENST00000265112 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 PTPN3-204ENST00000446349 8630 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 IKZF3-209ENST00000377952 1435 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 MORF4L2-201ENST00000360458 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 XRCC6P1-201ENST00000420392 1805 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 FNDC3A-206ENST00000541916 6328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 TP53BP1-203ENST00000382044 10384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 LAMP2-202ENST00000371335 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 TANC1-201ENST00000263635 7470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 PIGP-202ENST00000360525 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 GPR161-201ENST00000271357 7806 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 RUNX1T1-203ENST00000396218 3463 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 CDC42SE1-201ENST00000357235 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 CRIP3-201ENST00000274990 800 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 HMHB1-201ENST00000289448 384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
PTGFRP43088 OR1F1-201ENST00000304646 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.62□□□□□ -1.19
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