Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 LINC01695-203ENST00000453420 4486 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
TMEM225BP0DP42 PPP1R11-203ENST00000376765 1536 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TMEM225BP0DP42 CCDC47-207ENST00000612558 1586 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TMEM225BP0DP42 GPR182-201ENST00000300098 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
TMEM225BP0DP42 AC005520.1-201ENST00000556551 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TMEM225BP0DP42 LINC00598-214ENST00000637523 1943 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TMEM225BP0DP42 SCYL2-211ENST00000635101 3948 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TMEM225BP0DP42 RPL23AP7-202ENST00000416673 2078 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TMEM225BP0DP42 LINC01411-203ENST00000507361 2098 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TMEM225BP0DP42 CDH13-202ENST00000428848 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TMEM225BP0DP42 BTK-202ENST00000372880 2248 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TMEM225BP0DP42 CCPG1-212ENST00000569205 2970 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TMEM225BP0DP42 ERCC6-208ENST00000515869 3439 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TMEM225BP0DP42 FRMPD2-213ENST00000636244 4194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TMEM225BP0DP42 GON4L-219ENST00000622608 4801 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TMEM225BP0DP42 PPIP5K2-202ENST00000358359 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
TMEM225BP0DP42 ODF2L-203ENST00000359242 7560 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
TMEM225BP0DP42 TSC22D1-201ENST00000261489 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
TMEM225BP0DP42 HMHB1-201ENST00000289448 384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
TMEM225BP0DP42 ADH5-201ENST00000296412 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
TMEM225BP0DP42 OR56B4-201ENST00000316529 1152 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TMEM225BP0DP42 ATXN7L1-201ENST00000318724 1470 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
TMEM225BP0DP42 PPM1A-201ENST00000325642 1713 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TMEM225BP0DP42 PTMA-201ENST00000341369 1212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
TMEM225BP0DP42 OR2S2-201ENST00000341959 1047 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TMEM225BP0DP42 SP140-201ENST00000343805 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
TMEM225BP0DP42 PFDN5-203ENST00000351500 478 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
TMEM225BP0DP42 KCNIP2-204ENST00000353068 684 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
TMEM225BP0DP42 DPM1-203ENST00000371588 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
TMEM225BP0DP42 FBXO47-201ENST00000378079 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
TMEM225BP0DP42 RLN2-201ENST00000381627 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
TMEM225BP0DP42 CCL7-202ENST00000394627 696 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TMEM225BP0DP42 LINC01687-201ENST00000416327 795 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TMEM225BP0DP42 CELF2-203ENST00000416382 6894 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
TMEM225BP0DP42 RFESDP1-201ENST00000422350 461 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TMEM225BP0DP42 ADIPOQ-AS1-201ENST00000422718 3443 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TMEM225BP0DP42 RPL12P15-201ENST00000433385 499 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TMEM225BP0DP42 AL022313.3-201ENST00000433970 405 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TMEM225BP0DP42 USP9YP3-201ENST00000434481 1766 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TMEM225BP0DP42 GCNT1-202ENST00000442371 5972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
TMEM225BP0DP42 AL162253.1-201ENST00000443792 758 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TMEM225BP0DP42 FXYD6P2-201ENST00000444174 288 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TMEM225BP0DP42 PPP1R8P1-201ENST00000452549 1044 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TMEM225BP0DP42 C3orf67-AS1-201ENST00000463703 562 ntTSL 4 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TMEM225BP0DP42 ARMCX5-GPRASP2-206ENST00000476910 1848 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
TMEM225BP0DP42 INTS6-215ENST00000490542 2307 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TMEM225BP0DP42 RN7SL538P-201ENST00000494227 304 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TMEM225BP0DP42 AC026704.1-201ENST00000506435 770 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TMEM225BP0DP42 PPIAP11-201ENST00000510729 493 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TMEM225BP0DP42 LINC01438-201ENST00000512794 556 ntTSL 4 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TMEM225BP0DP42 AF121898.1-203ENST00000518494 826 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TMEM225BP0DP42 IGHV3-50-201ENST00000522107 317 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TMEM225BP0DP42 AC011632.1-201ENST00000523860 773 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TMEM225BP0DP42 HNRNPKP3-202ENST00000533565 589 ntTSL 4 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TMEM225BP0DP42 ASPH-230ENST00000541428 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TMEM225BP0DP42 ARHGDIB-207ENST00000541644 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TMEM225BP0DP42 PCBP2-207ENST00000546463 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
TMEM225BP0DP42 AL356019.1-201ENST00000553419 748 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TMEM225BP0DP42 MEG8-217ENST00000556637 924 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TMEM225BP0DP42 AC060814.2-201ENST00000556905 1089 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TMEM225BP0DP42 OR4K4P-201ENST00000556991 684 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TMEM225BP0DP42 AC093249.3-201ENST00000562444 424 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TMEM225BP0DP42 AC009075.1-201ENST00000563347 391 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TMEM225BP0DP42 AC133065.3-201ENST00000577174 1161 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TMEM225BP0DP42 EIF3K-211ENST00000592558 670 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TMEM225BP0DP42 AC011453.1-201ENST00000597619 2239 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TMEM225BP0DP42 STX8P1-201ENST00000603161 355 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TMEM225BP0DP42 AC104958.2-201ENST00000605955 1141 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TMEM225BP0DP42 MIR6848-201ENST00000611213 70 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TMEM225BP0DP42 PHBP6-201ENST00000614021 786 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TMEM225BP0DP42 Metazoa_SRP.148-201ENST00000614489 291 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TMEM225BP0DP42 TMPRSS4-219ENST00000616579 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TMEM225BP0DP42 UBE2V1-223ENST00000617119 2432 ntTSL 4 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TMEM225BP0DP42 CCL4L2-213ENST00000617405 846 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
TMEM225BP0DP42 PDE4DIP-246ENST00000618462 8150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
TMEM225BP0DP42 XKRY2-202ENST00000623874 1581 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TMEM225BP0DP42 XKRY-202ENST00000624960 1581 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TMEM225BP0DP42 CEP85-209ENST00000640292 2286 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TMEM225BP0DP42 TMCC1-202ENST00000426664 5484 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
TMEM225BP0DP42 HK1-203ENST00000360289 3961 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
TMEM225BP0DP42 RYBP-201ENST00000477973 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
TMEM225BP0DP42 SCIN-201ENST00000297029 9713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
TMEM225BP0DP42 TRIM6-203ENST00000380107 2590 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
TMEM225BP0DP42 CSRNP3-203ENST00000409420 2545 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
TMEM225BP0DP42 LINC00607-204ENST00000423530 2104 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
TMEM225BP0DP42 NFIA-206ENST00000371191 1916 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
TMEM225BP0DP42 MTMR3-205ENST00000406629 3758 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
TMEM225BP0DP42 AC013470.2-202ENST00000635746 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
TMEM225BP0DP42 SEC23IP-201ENST00000369075 7168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
TMEM225BP0DP42 GRHL1-201ENST00000324907 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
TMEM225BP0DP42 ACSM6-202ENST00000341686 1712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
TMEM225BP0DP42 GP2-201ENST00000302555 3406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
TMEM225BP0DP42 ZNF343-208ENST00000617391 3300 ntTSL 4 BASIC7.64□□□□□ -1.19
TMEM225BP0DP42 PREPL-204ENST00000409272 3030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
TMEM225BP0DP42 SKIV2L2-201ENST00000230640 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
TMEM225BP0DP42 SOCS5P2-201ENST00000449637 1359 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
TMEM225BP0DP42 CTBP2P2-201ENST00000434549 1334 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
TMEM225BP0DP42 SPANXC-201ENST00000358993 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
TMEM225BP0DP42 AC009967.1-201ENST00000379462 793 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
TMEM225BP0DP42 VPS53-203ENST00000401468 1269 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms