Protein–RNA interactions for Protein: U3KQK5

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQK5 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
U3KQK5 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
U3KQK5 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
U3KQK5 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
U3KQK5 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
U3KQK5 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
U3KQK5 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
U3KQK5 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
U3KQK5 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
U3KQK5 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
U3KQK5 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
U3KQK5 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
U3KQK5 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
U3KQK5 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
U3KQK5 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
U3KQK5 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
U3KQK5 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
U3KQK5 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
U3KQK5 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
U3KQK5 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
U3KQK5 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
U3KQK5 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
U3KQK5 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
U3KQK5 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
U3KQK5 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
U3KQK5 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
U3KQK5 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
U3KQK5 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
U3KQK5 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
U3KQK5 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
U3KQK5 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
U3KQK5 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
U3KQK5 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
U3KQK5 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
U3KQK5 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
U3KQK5 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
U3KQK5 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
U3KQK5 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
U3KQK5 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
U3KQK5 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
U3KQK5 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
U3KQK5 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
U3KQK5 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
U3KQK5 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
U3KQK5 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
U3KQK5 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
U3KQK5 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
U3KQK5 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
U3KQK5 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
U3KQK5 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
U3KQK5 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
U3KQK5 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
U3KQK5 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
U3KQK5 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
U3KQK5 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
U3KQK5 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
U3KQK5 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
U3KQK5 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
U3KQK5 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
U3KQK5 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
U3KQK5 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
U3KQK5 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
U3KQK5 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
U3KQK5 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
U3KQK5 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
U3KQK5 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
U3KQK5 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
U3KQK5 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
U3KQK5 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
U3KQK5 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
U3KQK5 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
U3KQK5 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
U3KQK5 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
U3KQK5 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
U3KQK5 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
U3KQK5 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
U3KQK5 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
U3KQK5 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
U3KQK5 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
U3KQK5 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
U3KQK5 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
U3KQK5 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
U3KQK5 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
U3KQK5 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
U3KQK5 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
U3KQK5 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
U3KQK5 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
U3KQK5 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
U3KQK5 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
U3KQK5 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
U3KQK5 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
U3KQK5 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
U3KQK5 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
U3KQK5 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
U3KQK5 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
U3KQK5 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
U3KQK5 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
U3KQK5 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
U3KQK5 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
U3KQK5 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms