Protein–RNA interactions for Protein: U3KPV4

A3GALT2, Alpha-1,3-galactosyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A3GALT2U3KPV4 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
A3GALT2U3KPV4 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
A3GALT2U3KPV4 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
A3GALT2U3KPV4 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
A3GALT2U3KPV4 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
A3GALT2U3KPV4 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
A3GALT2U3KPV4 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
A3GALT2U3KPV4 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
A3GALT2U3KPV4 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
A3GALT2U3KPV4 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
A3GALT2U3KPV4 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
A3GALT2U3KPV4 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
A3GALT2U3KPV4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
A3GALT2U3KPV4 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
A3GALT2U3KPV4 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
A3GALT2U3KPV4 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
A3GALT2U3KPV4 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
A3GALT2U3KPV4 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
A3GALT2U3KPV4 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
A3GALT2U3KPV4 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
A3GALT2U3KPV4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
A3GALT2U3KPV4 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
A3GALT2U3KPV4 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
A3GALT2U3KPV4 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
A3GALT2U3KPV4 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
A3GALT2U3KPV4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
A3GALT2U3KPV4 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
A3GALT2U3KPV4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
A3GALT2U3KPV4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
A3GALT2U3KPV4 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
A3GALT2U3KPV4 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
A3GALT2U3KPV4 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
A3GALT2U3KPV4 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
A3GALT2U3KPV4 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
A3GALT2U3KPV4 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
A3GALT2U3KPV4 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
A3GALT2U3KPV4 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
A3GALT2U3KPV4 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
A3GALT2U3KPV4 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
A3GALT2U3KPV4 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
A3GALT2U3KPV4 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
A3GALT2U3KPV4 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
A3GALT2U3KPV4 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
A3GALT2U3KPV4 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
A3GALT2U3KPV4 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
A3GALT2U3KPV4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
A3GALT2U3KPV4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
A3GALT2U3KPV4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
A3GALT2U3KPV4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
A3GALT2U3KPV4 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
A3GALT2U3KPV4 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
A3GALT2U3KPV4 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
A3GALT2U3KPV4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
A3GALT2U3KPV4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
A3GALT2U3KPV4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
A3GALT2U3KPV4 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
A3GALT2U3KPV4 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
A3GALT2U3KPV4 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
A3GALT2U3KPV4 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
A3GALT2U3KPV4 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
A3GALT2U3KPV4 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
A3GALT2U3KPV4 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
A3GALT2U3KPV4 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
A3GALT2U3KPV4 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
A3GALT2U3KPV4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
A3GALT2U3KPV4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
A3GALT2U3KPV4 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
A3GALT2U3KPV4 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
A3GALT2U3KPV4 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
A3GALT2U3KPV4 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
A3GALT2U3KPV4 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
A3GALT2U3KPV4 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
A3GALT2U3KPV4 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
A3GALT2U3KPV4 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
A3GALT2U3KPV4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
A3GALT2U3KPV4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
A3GALT2U3KPV4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
A3GALT2U3KPV4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
A3GALT2U3KPV4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
A3GALT2U3KPV4 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
A3GALT2U3KPV4 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
A3GALT2U3KPV4 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
A3GALT2U3KPV4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
A3GALT2U3KPV4 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
A3GALT2U3KPV4 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
A3GALT2U3KPV4 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
A3GALT2U3KPV4 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
A3GALT2U3KPV4 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
A3GALT2U3KPV4 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
A3GALT2U3KPV4 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
A3GALT2U3KPV4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
A3GALT2U3KPV4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
A3GALT2U3KPV4 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
A3GALT2U3KPV4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
A3GALT2U3KPV4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
A3GALT2U3KPV4 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
A3GALT2U3KPV4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
A3GALT2U3KPV4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
A3GALT2U3KPV4 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
A3GALT2U3KPV4 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms